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1. (WO2018137496) METHOD AND DEVICE FOR DETERMINING PROPORTION OF FREE NUCLEOTIDE FROM PREDETERMINED SOURCE IN BIOLOGICAL SAMPLE
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Pub. No.: WO/2018/137496 International Application No.: PCT/CN2018/072045
Publication Date: 02.08.2018 International Filing Date: 10.01.2018
IPC:
C12Q 1/68 (2018.01) ,C12M 1/00 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
M
APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY
1
Apparatus for enzymology or microbiology
Applicants:
深圳华大基因股份有限公司 BGI GENOMICS CO., LTD. [CN/CN]; 中国广东省深圳市 盐田区洪安三街21号华大综合园7栋7层-14层 FLOORS 7-14, BUILDING NO. 7, BGI PARK, NO. 21 HONGAN 3RD STREET, YANTIAN DISTRICT SHENZHEN, Guangdong 518083, CN
Inventors:
袁玉英 YUAN, Yuying; CN
柴相花 CHAI, Xianghua; CN
王书元 WANG, Shuyuan; CN
陈丽娜 CHEN, Lina; CN
周丽君 ZHOU, Lijun; CN
刘强 LIU, Qiang; CN
张红云 ZHANG, Hongyun; CN
王威 WANG, Wei; CN
刘娜 LIU, Na; CN
尹烨 YIN, Ye; CN
Agent:
北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) TSINGYIHUA INTELLECTUAL PROPERTY LLC; 中国北京市 海淀区清华园清华大学照澜院商业楼301室 Room 301 Trade Building, Zhaolanyuan, Tsinghua University, Qinghuayuan, Haidian District Beijing 100084, CN
Priority Data:
201710055200.024.01.2017CN
Title (EN) METHOD AND DEVICE FOR DETERMINING PROPORTION OF FREE NUCLEOTIDE FROM PREDETERMINED SOURCE IN BIOLOGICAL SAMPLE
(FR) PROCÉDÉ ET DISPOSITIF POUR DÉTERMINER UNE PROPORTION DE NUCLÉOTIDE LIBRE PROVENANT D'UNE SOURCE PRÉDÉTERMINÉE DANS UN ÉCHANTILLON BIOLOGIQUE
(ZH) 确定生物样本中预定来源的游离核酸比例的方法及装置
Abstract:
(EN) Disclosed are a method and device for determining the proportion of a free nucleotide from a predetermined source in a biological sample. The method comprises: (1) performing nucleic acid sequencing on a biological sample comprising a free nucleotide to obtain a sequencing result consisting of multiple pieces of sequencing data; (2) comparing the sequencing result with a reference sequence to determine the number of pieces of sequencing data falling within a predetermined window in the sequencing result; and (3) determining the proportion of the free nucleotide from a predetermined source in the biological sample on the basis of the number of pieces of sequencing data falling within the predetermined window.
(FR) L'invention concerne un procédé et un dispositif pour déterminer la proportion d'un nucléotide libre provenant d'une source prédéterminée dans un échantillon biologique. Le procédé comprend : (1) la réalisation d'un séquençage d'acide nucléique sur un échantillon biologique comprenant un nucléotide libre pour obtenir un résultat de séquençage constitué par de multiples éléments de données de séquençage ; (2) la comparaison du résultat de séquençage à une séquence de référence pour déterminer le nombre d'éléments de données de séquençage se situant à l'intérieur d'une fenêtre prédéterminée dans le résultat de séquençage ; et (3) la détermination de la proportion du nucléotide libre provenant d'une source prédéterminée dans l'échantillon biologique sur la base du nombre d'éléments de données de séquençage se situant à l'intérieur de la fenêtre prédéterminée.
(ZH) 本发明公开了确定生物样本中预定来源的游离核酸比例的方法及装置,包括:(1)对含有游离核酸的生物样本进行核酸测序,以便获得由多个测序数据构成的测序结果;(2)将所述测序结果与参照序列比对,以便确定所述测序结果中落入预定窗口的测序数据的数目;以及(3)基于所述落入预定窗口的测序数据的数目,确定所述生物样本中预定来源的游离核酸比例。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
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Publication Language: Chinese (ZH)
Filing Language: Chinese (ZH)