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1. (WO2018122459) CALCIUM LEVEL ANALYSIS IN CARDIOMYOCYTE
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Pub. No.: WO/2018/122459 International Application No.: PCT/FI2017/050945
Publication Date: 05.07.2018 International Filing Date: 28.12.2017
IPC:
G06K 9/00 (2006.01) ,C12N 5/077 (2010.01)
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
K
RECOGNITION OF DATA; PRESENTATION OF DATA; RECORD CARRIERS; HANDLING RECORD CARRIERS
9
Methods or arrangements for reading or recognising printed or written characters or for recognising patterns, e.g. fingerprints
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
N
MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
5
Undifferentiated human, animal or plant cells, e.g. cell lines; Tissues; Cultivation or maintenance thereof; Culture media therefor
07
Animal cells or tissues
071
Vertebrate cells or tissues, e.g. human cells or tissues
077
Mesenchymal cells, e.g. bone cells, cartilage cells, marrow stromal cells, fat cells or muscle cells
Applicants:
TAMPEREEN YLIOPISTO [FI/FI]; Kalevantie 4 33014 TAMPEREEN YLIOPISTO, FI
TTY-SÄÄTIÖ [FI/FI]; PL 527 33101 TAMPERE, FI
TAYS SYDÄNKESKUS OY [FI/FI]; PL 2000 33521 TAMPERE, FI
Inventors:
AALTO-SETÄLÄ, Katriina; FI
PENTTINEN, Kirsi; FI
JUHOLA, Martti; FI
JOUTSIJOKI, Henry; FI
Agent:
BERGGREN OY; P.O.BOX 16 (Eteläinen Rautatiekatu 10 A) 00101 HELSINKI, FI
Priority Data:
2017500302.01.2017FI
Title (EN) CALCIUM LEVEL ANALYSIS IN CARDIOMYOCYTE
(FR) ANALYSE DU TAUX DE CALCIUM DANS UN CARDIOMYOCYTE
Abstract:
(EN) A technique for calcium analysis on basis of a calcium signal that comprises a time series of samples that are descriptive of calcium level in a cardiomyocyte as a function of time is provided. According to an example, the technique involves a method that comprises identifying calcium peaks in the calcium signal; deriving, for each identified calcium peak, respective values for a plurality of peak characteristics that include at least one of the following: a change in calcium level indicated by the calcium peak, a rate of change in calcium level indicated by the calcium peak, a temporal duration of the calcium peak, and a time difference to an adjacent calcium peak of the calcium signal; classifying each identified calcium peak into one of a plurality of classes on basis of said values derived for the respective peak in dependence of predefined classification information that represents said plurality of classes, wherein each of said plurality of classes represents a respective predetermined cardiac condition; and assigning said cardiomyocyte to one of said plurality of classes in accordance with the respective classifications.
(FR) L'invention concerne une technique d'analyse du calcium en fonction d'un signal de calcium qui comprend une série chronologique d'échantillons qui décrivent le niveau de calcium dans un cardiomyocyte en fonction du temps. Selon un exemple, la technique met en jeu un procédé qui consiste à identifier des pics de calcium dans le signal de calcium ; dériver, pour chaque pic de calcium identifié, des valeurs respectives pour une pluralité de caractéristiques de pic qui contiennent au moins un des éléments suivants : un changement du taux de calcium indiqué par le pic de calcium, une vitesse de changement du taux de calcium indiqué par le pic de calcium, une durée temporelle du pic de calcium, et une différence de temps jusqu'à un pic de calcium adjacent du signal de calcium ; classifier chaque pic de calcium identifié dans une classe d'une pluralité de classes en fonction desdites valeurs dérivées pour le pic respectif en fonction d'informations de classification prédéfinies qui représentent ladite pluralité de classes, chaque classe de ladite pluralité de classes représentant un état cardiaque respectif prédéterminé ; et attribuer ledit cardiomyocyte à une classe de ladite pluralité de classes selon les classifications respectives.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)