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1. (WO2018087303) ELECTROCHEMICAL DNA DETECTION
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Pub. No.: WO/2018/087303 International Application No.: PCT/EP2017/078912
Publication Date: 17.05.2018 International Filing Date: 10.11.2017
IPC:
C12Q 1/68
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
Applicants:
GENOMICA, S.A.U. [ES/ES]; Parque Empresarial Alvento Edificio B C. Vía de los Poblados, 1, 1ª planta 28033 Madrid, ES
Inventors:
VILLAHERMOSA JAEN, María Luisa; ES
CALVO MACARRO, Francisco Javier; ES
Agent:
BALDER IP LAW, S.L.; Paseo de la Castellana 93 5ª planta 28046 Madrid, ES
Priority Data:
16382527.611.11.2016EP
Title (EN) ELECTROCHEMICAL DNA DETECTION
(FR) DÉTECTION ÉLECTROCHIMIQUE D'ADN
Abstract:
(EN) Electrochemical DNA detection methods are disclosed comprising the steps of: i) Amplifying a target DNA with at least one amplification primer, wherein the at least one amplification primer is chemically linked to a label through its 5' end; ii) Denaturing the amplified product to yield two molecules of single stranded DNA (ssDNA) of which at least one is 5'-labeled; iii) Hybridizing a 5'-labeled ssDNA molecule of the amplified product with a complementary oligonucleotide capture probe which is attached through its 3' end to an electrode; and iv) Determining the presence of the label associated with the hybridization product; wherein the distance between the 5'-end and the first nucleotide of the hybridization region within the ssDNA molecule that hybridises to the complementary oligonucleotide capture probe is comprised from 0 to 280 nucleotides. Cartridge devices, operator devices, methods of controlling an operator device, and computer programs implementing said methods are also disclosed, which are suitable for performing such electrochemical DNA detection methods.
(FR) L'invention concerne des méthodes de détection électrochimique d'ADN comprenant les étapes consistant à : i) amplifier un ADN cible avec au moins une amorce d'amplification, ladite amorce d'amplification étant chimiquement liée à un marqueur par son extrémité 5 '; ii) dénaturer le produit amplifié pour produire deux molécules d'ADN monocaténaire (ssDNA) dont au moins une est marquée en 5 '; iii) hybrider une molécule d'ADN monocaténaire marquée en 5' du produit amplifié avec une sonde de capture d'oligonucléotide complémentaire qui est fixée par son extrémité 3' à une électrode; et iv) déterminer la présence du marqueur associé au produit d'hybridation; la distance entre l'extrémité 5' et le premier nucléotide de la région d'hybridation à l'intérieur de la molécule d'ADN monocaténaire qui s'hybride à la sonde de capture d'oligonucléotide complémentaire étant comprise entre 0 et 280 nucléotides. L'invention concerne également des dispositifs de cartouche, des dispositifs de commande, des méthodes de contrôle d'un dispositif de commande, et des programmes informatiques mettant en oeuvre lesdites méthodes, qui sont appropriés pour réaliser de telles méthodes de détection électrochimique d'ADN.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)