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1. (WO2018060451) PRIMERS AND PROBES FOR DIAGNOSIS OF DERMATOPHYTE INFECTION
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Pub. No.:    WO/2018/060451    International Application No.:    PCT/EP2017/074822
Publication Date: 05.04.2018 International Filing Date: 29.09.2017
IPC:
C12Q 1/68
Applicants: UNIVERSITÄT ZÜRICH [CH/CH]; Prorektorat VNW Rämistr. 71 8006 Zürich (CH)
Inventors: BOSSHARD, Philipp; (CH).
WALSER, Michael; (CH)
Agent: JUNGHANS, Claas; (DE)
Priority Data:
16191993.1 30.09.2016 EP
16191992.3 30.09.2016 EP
Title (EN) PRIMERS AND PROBES FOR DIAGNOSIS OF DERMATOPHYTE INFECTION
(FR) AMORCES ET SONDES POUR LE DIAGNOSTIC D'UNE INFECTION A DERMATOPHYTE
Abstract: front page image
(EN)The invention relates to a method of detection and species identification of dermatophytes in a patient sample. The method comprises a PCR step using a pair of consensus primers; a probe annealing step, in which a plurality of oligonucleotide probes is brought in contact with the product of the PCR step and a detectable fluorescent signal is obtained if the probes hybridize; a temperature ramping step determining the denaturation temperature of the probes from the PCR product; and an evaluation step in which the denaturation temperatures are used to identify the dermatophyte species present in the sample. The invention further relates to a method of detection of non-dermatophyte nail-infection causing fungal species.
(FR)L'invention concerne un procédé de détection et d'identification d'espèces de dermatophytes dans l'échantillon d'un patient. Le procédé comprend une étape de PCR utilisant une paire d'amorces consensus; une étape de recuit de sonde, dans laquelle une pluralité de sondes oligonucléotidiques est mise en contact avec le produit de l'étape de PCR et un signal fluorescent détectable est obtenu si les sondes s'hybrident; une étape de variation de température déterminant la température de dénaturation des sondes du produit de PCR; et une étape d'évaluation dans laquelle les températures de dénaturation sont utilisées pour identifier les espèces de dermatophytes présentes dans l'échantillon. L'invention concerne en outre un procédé de détection d'une infection des ongles non dermatophyte due à des espèces fongiques.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)