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1. (WO2018057928) METHODS OF PREPARING AND ANALYZING CELL-FREE NUCLEIC ACID SEQUENCING LIBRARIES
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Pub. No.:    WO/2018/057928    International Application No.:    PCT/US2017/053012
Publication Date: 29.03.2018 International Filing Date: 22.09.2017
IPC:
C12Q 1/68, C12N 15/10 (2006.01)
Applicants: GRAIL, INC. [US/US]; 1525 O'Brien Drive Menlo Park, California 94025 (US)
Inventors: LARSON, Matthew H.; (--).
KIM, Hyunsung John; (--).
EATTOCK, Nick; (--).
YANG, Xiao; (--)
Agent: PELLETIER, Benjamin C.; (US).
DREGER, Ginger; (US).
DEVRY, Christopher; (US).
GOETZ, David; (US)
Priority Data:
62/399,167 23.09.2016 US
62/456,029 07.02.2017 US
Title (EN) METHODS OF PREPARING AND ANALYZING CELL-FREE NUCLEIC ACID SEQUENCING LIBRARIES
(FR) PROCÉDÉS DE PRÉPARATION ET D'ANALYSE DE BIBLIOTHÈQUES DE SÉQUENÇAGE D'ACIDE NUCLÉIQUE ACELLULAIRE
Abstract: front page image
(EN)Aspects of the invention relate to methods for preparing and analyzing a sequencing library from a mixed cell-free DNA (cfDNA) sample, wherein the mixed sample includes double-stranded DNA (dsDNA), damaged dsDNA (e.g., nicked dsDNA), and single-stranded DNA (ssDNA) molecules. The subject methods facilitate the collection of information from dsDNA, ssDNA and damaged DNA (e.g., nicked DNA) molecules in a sample, thereby providing enhanced diagnostic information as compared to sequencing libraries that are prepared from dsDNA alone.
(FR)L'invention concerne, dans certains aspects, des procédés permettant de préparer et d'analyser une bibliothèque de séquençage à partir d'un échantillon d'ADN acellulaire (ADNcf) mixte, ledit échantillon mixte comprenant des molécules d'ADN double brin (ADNds), d'ADN double brin endommagé (par exemple ADNds incisé) et d'ADN simple brin (ADNss). Les procédés selon l'invention facilitent la collecte d'informations à partir des molécules d'ADNds, d'ADNss et d'ADN endommagé (par exemple ADN incisé) présentes dans un échantillon, ce qui donne de meilleures informations relatives au diagnostic par rapport aux bibliothèques de séquençage préparées à partir d'ADNds seulement.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)