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1. (WO2018053761) DATA PROCESSING METHOD AND DEVICE, AND COMPUTING NODE
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Pub. No.:    WO/2018/053761    International Application No.:    PCT/CN2016/099739
Publication Date: 29.03.2018 International Filing Date: 22.09.2016
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: HUAWEI TECHNOLOGIES CO., LTD. [CN/CN]; Huawei Administration Building, Bantian, Longgang District Shenzhen, Guangdong 518129 (CN)
Inventors: DENG, Liqun; (CN).
HUANG, Guowei; (CN).
WEI, Jiansheng; (CN)
Agent: SCIHEAD IP LAW FIRM; Room 1508, Huihua Commercial & Trade Building No. 80, XianLie Zhong Road, Yuexiu District Guangzhou, Guangdong 510070 (CN)
Priority Data:
Title (EN) DATA PROCESSING METHOD AND DEVICE, AND COMPUTING NODE
(FR) PROCÉDÉ ET DISPOSITIF DE TRAITEMENT DE DONNÉES ET NŒUD DE CALCUL INFORMATISÉ
(ZH) 一种数据处理方法、装置及计算节点
Abstract: front page image
(EN)A data processing method and device, and a computing node. The method comprises: a computing node classifies reattach result sequences corresponding to a DNA read strand to be reattached into a reattach result sequence set corresponding to a corresponding target chromosome region, determines whether the number of the reattach result sequences comprised in the reattach result sequence set is greater than or equal to a predetermined number threshold, if yes, divides the reattach result sequence set into k reattach result sequence subsets according to a preset division rule, also divides the target chromosome region into k chromosome subregions having a one-to-one correspondence to the k reattach result sequence subsets, then divides a gene analysis task for the reattach result sequence set into k gene analysis subtasks, and executes the k gene analysis subtasks in parallel. Embodiments of the present invention can improve the execution efficiency of a gene analysis task and reduce the time overhead of the gene analysis task.
(FR)L'invention concerne un procédé et un dispositif de traitement de données et un noeud de calcul informatisé. Le procédé comprend les étapes suivantes : un noeud de calcul informatisé classifie des séquences de résultats de rattachement correspondant à un brin de lecture d'ADN à rattacher dans un ensemble de séquences de résultats de rattachement correspondant à une région chromosomique cible, détermine si le nombre de séquences de résultats de rattachement compris dans l'ensemble de séquences de résultats de rattachement est supérieur ou égal à un seuil numérique prédéterminé, si oui, divise l'ensemble de séquences de résultats de rattachement en k sous-ensembles de séquences de résultats de rattachement selon une règle de division prédéfinie, divise également la région chromosomique cible en k sous-régions chromosomiques présentant une correspondance biunivoque par rapport aux k sous-ensembles de séquences de résultats de rattachement, puis divise une tâche d'analyse génique pour l'ensemble de séquences de résultats de rattachement en k sous-tâches d'analyse génique et exécute les k sous-tâches d'analyse génique en parallèle. Des modes de réalisation de la présente invention peuvent améliorer l'efficacité d'exécution d'une tâche d'analyse génique et réduire le temps système de la tâche d'analyse génique.
(ZH)一种数据处理方法、装置及计算节点,其中方法包括:计算节点将待回贴DNA读串对应的回贴结果序列划分到相应的目标染色体区域对应的回贴结果序列集中,判断该回贴结果序列集中包括的回贴结果序列数量是否大于或等于预先确定的数量阈值,如果是,则按照预设划分规则将该回贴结果序列集划分成k个回贴结果序列子集,对应地,将该目标染色体区域也划分成k个与该k个回贴结果序列子集一一对应的染色体子区域,进而将针对该回贴结果序列集的基因分析任务划分成k个基因分析子任务,并行地执行该k个基因分析子任务。本发明实施例可以提高基因分析任务的执行效率,缩短基因分析任务的时间开销。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Chinese (ZH)
Filing Language: Chinese (ZH)