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1. (WO2018053443) METHOD AND SYSTEM FOR PANEL CHARACTERIZATIONS
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Pub. No.:    WO/2018/053443    International Application No.:    PCT/US2017/052098
Publication Date: 22.03.2018 International Filing Date: 18.09.2017
IPC:
A61B 5/05 (2006.01), A61B 1/00 (2006.01), G06F 19/00 (2018.01)
Applicants: UBIOME, INC. [US/US]; 360 Langton Street, #301 San Francisco, CA 94103 (US)
Inventors: ALMONACID, Daniel; (US).
KRAAL, Laurens; (US).
OSSANDON, Francisco; (US).
CARDENAS, Juan, Pablo; (US).
RICHMAN, Jessica; (US).
APTE, Zachary; (US).
BIK, Elisabeth; (US).
GODDARD, Audrey; (US)
Agent: SCHOX, Jeffrey; (US)
Priority Data:
62/395,939 16.09.2016 US
62/520,058 15.06.2017 US
62/525,379 27.06.2017 US
15/606,743 26.05.2017 US
Title (EN) METHOD AND SYSTEM FOR PANEL CHARACTERIZATIONS
(FR) MÉTHODE ET SYSTÈME DE CARACTÉRISATIONS DE PANEL
Abstract: front page image
(EN)Embodiments of a system and method for characterizing a panel of conditions associated with a set of taxa related to microorganisms can include a taxonomic database including reference microbiome features for the set of taxa associated with the panel of conditions; a handling operable to collect a container including biological material from a user, the handling system comprising a sequencer system operable to determine a microorganism sequence dataset; and a panel characterization system operable to: determine user microbiome features for the set of taxa for the user based on the microorganism sequence dataset, generate a comparison between the user microbiome features and the reference microbiome features, and determine a panel characterization for the panel of conditions for the user based on the comparison; and a treatment system operable to promote a therapy for a condition of the panel of conditions based on the panel characterization.
(FR)Certains modes de réalisation d'un système et d'une méthode de caractérisation d'un panel de conditions associées à un ensemble de taxa relatifs à des micro-organismes peuvent faire appel à une base de données taxinomique comprenant des caractéristiques de microbiome de référence concernant l'ensemble de taxa associé au panel de conditions ; un système de manipulation pouvant servir à collecter un contenant comprenant un matériel biologique provenant d'un utilisateur, le système de manipulation comprenant un système séquenceur pouvant servir à déterminer un ensemble de données de séquences de micro-organismes ; et un système de caractérisation de panel pouvant servir à : déterminer des caractéristiques de microbiome d'utilisateur de l'ensemble de taxa pour l'utilisateur sur la base de l'ensemble de données de séquences de micro-organismes, générer une comparaison entre les caractéristiques de microbiome d'utilisateur et les caractéristiques de microbiome de référence, et déterminer une caractérisation de panel du panel de conditions pour l'utilisateur sur la base de la comparaison ; et un système de traitement pouvant servir à promouvoir une thérapie pour une condition du panel de conditions sur la base de la caractérisation de panel.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)