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1. (WO2018052912) PATHOGEN QUANTIFICATION USING LABELED PROBES
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Pub. No.:    WO/2018/052912    International Application No.:    PCT/US2017/051227
Publication Date: 22.03.2018 International Filing Date: 12.09.2017
IPC:
C12Q 1/02 (2006.01), C12Q 1/18 (2006.01), C12Q 1/70 (2006.01), C07K 14/16 (2006.01), C07K 14/155 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01), G01N 33/52 (2006.01), G06T 7/40 (2017.01)
Applicants: OREGON HEALTH & SCIENCE UNIVERSITY [US/US]; 0690 SW Bancroft Street Portland, Oregon 97239 (US)
Inventors: QUOC VU, Tothu (Tania); (US).
JACOB, Thomas; (US)
Agent: ECK, Steven; (US)
Priority Data:
62/393,951 13.09.2016 US
Title (EN) PATHOGEN QUANTIFICATION USING LABELED PROBES
(FR) QUANTIFICATION DE PATHOGÈNES À L'AIDE DE SONDES MARQUÉES
Abstract: front page image
(EN)Methods and systems for quantifying cellular activity using labeled probes, e.g., quantum dots, are disclosed. In one example approach, a method for quantifying pathogen activity in a sample containing intact cells having labeled complexes comprises receiving images of the sample at a plurality of depths and detecting individual intact cells in the images of the sample at the plurality of depths. For each detected pathogen, discrete labels may be detected and localized in the cell at each depth, a total number of detected and localized labels may be calculated in the cell, and an activity level of the target molecule for the labeled probe in the cell determined.
(FR)L’invention concerne des procédés et des systèmes de quantification de l’activité cellulaire au moyen de sondes identifiées, par ex., des points quantiques. Selon une approche illustrative, un procédé de quantification d’activité cellulaire dans un échantillon contenant des cellules intactes comportant des complexes marqués consiste à recevoir des images de l’échantillon à une pluralité de profondeurs et à détecter des cellules intactes individuelles dans les images de l’échantillon à la pluralité de profondeurs. Pour chaque pathogène détecté, des marqueurs distincts peuvent être détectés et localisés dans la cellule à chaque profondeur, un nombre total de marqueurs détectés et localisés peut être calculé dans la cellule, et un niveau d’activité de la molécule cible pour la sonde marquée dans la cellule peut être déterminé.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)