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1. (WO2018050722) METHODS FOR LABELLING NUCLEIC ACIDS
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Pub. No.:    WO/2018/050722    International Application No.:    PCT/EP2017/073064
Publication Date: 22.03.2018 International Filing Date: 13.09.2017
IPC:
C12Q 1/68
Applicants: INIVATA LIMITED [GB/GB]; The Portway Granta Park Great Abington Cambridge, England CB21 6GS (GB)
Inventors: FORSHEW, Tim; (GB).
WOODHOUSE, Samuel; (GB).
LENSING, Stefanie Viola; (GB)
Agent: LEONARD, Thomas; (GB)
Priority Data:
1615486.6 13.09.2016 GB
Title (EN) METHODS FOR LABELLING NUCLEIC ACIDS
(FR) PROCÉDÉS DESTINÉ AU MARQUAGE DES ACIDES NUCLÉIQUES
Abstract: front page image
(EN)The invention relates to methods for labelling individual nucleic acid molecules present in a sample, comprising contacting the nucleic acid molecules with an adaptor or mixture of adaptors, wherein the adaptor or adaptors comprise one or more universal nucleotide bases and a ligation moiety at their 3' end, and ligating an adaptor to the nucleic acid of interest, wherein the adaptor is ligated to the nucleic acid molecules at the 3' end of the adaptor. A random tag is then generated in situ by conducting an extension reaction over the ligated adaptor. Methods of the invention may be used to detect genetic alterations or variants in any nucleic acid with high specificity and high sensitivity, including mutations in nucleic acids such as ctDNA, cfDNA, and in viral, microbiome and plant nucleic acids. Methods of the invention may also be used in detection and correction of errors introduced into nucleic acids during processing.
(FR)L'invention concerne des procédés de marquage de molécules d'acide nucléique individuelles présentes dans un échantillon, comprenant la mise en contact des molécules d'acide nucléique avec un adaptateur ou un mélange d'adaptateurs, l'adaptateur ou les adaptateurs comprenant une ou plusieurs bases nucléotidiques universelles et une fraction de ligature au niveau de leur extrémité 3', et la ligature d'un adaptateur à l'acide nucléique d'intérêt, l'adaptateur étant ligaturé aux molécules d'acide nucléique au niveau de l'extrémité 3' de l'adaptateur. Un marqueur aléatoire est ensuite généré in situ par réalisation d'une réaction d'extension sur l'adaptateur ligaturé. Les procédés de l'invention peuvent être utilisés pour détecter des altérations génétiques ou des variants dans n'importe quel acide nucléique avec une spécificité élevée et une sensibilité élevée, y compris des mutations dans des acides nucléiques tels que l'ADNtc, l'ADNac, et dans des acides nucléiques de virus, de microbiome et de plante. Les procédés de l'invention peuvent également être utilisés dans la détection et la correction d'erreurs introduites dans des acides nucléiques pendant le traitement.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)