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1. (WO2018049793) METHOD FOR QUANTITATIVELY ANALYZING MODULE CHANGE IN BIOMOLECULAR NETWORKS BEFORE AND AFTER DRUG INTERVENTION
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Pub. No.:    WO/2018/049793    International Application No.:    PCT/CN2017/075604
Publication Date: 22.03.2018 International Filing Date: 03.03.2017
IPC:
G06F 19/12 (2011.01)
Applicants: WANG, Zhong [CN/CN]; (CN).
YU, Yanan [CN/CN]; (CN)
Inventors: WANG, Zhong; (CN).
YU, Yanan; (CN)
Agent: LEADING INTELLECTUAL PROPERTY FIRM; Room 909, 9th Floor, Tower B, Fortune Building, No.17, Daliushu Road, Haidian District Beijing 100081 (CN)
Priority Data:
201610826031.1 14.09.2016 CN
Title (EN) METHOD FOR QUANTITATIVELY ANALYZING MODULE CHANGE IN BIOMOLECULAR NETWORKS BEFORE AND AFTER DRUG INTERVENTION
(FR) PROCÉDÉ D'ANALYSE QUANTITATIVE DE CHANGEMENT DE MODULE DANS DES RÉSEAUX BIOMOLÉCULAIRES AVANT ET APRÈS UNE INTERVENTION PAR MÉDICAMENT
(ZH) 一种用于定量分析药物干预前后生物分子网络中模块变化的方法
Abstract: front page image
(EN)A quantitative analysis method, the method being used for quantitatively comparing a degree of change of modules of biomolecular networks before and after drug intervention. The method integrates module topological parameters having different dimensions (attributes), constructs and quantifies a global, comprehensive index of module change, and quantitatively analyzes and compares the degree of change of the modules of the biomolecular networks before and after drug intervention. The method comprises: 1) constructing a biomolecular network before drug intervention and a biomolecular network after drug intervention, and identifying a module of the biomolecular network before drug intervention and a module of the biomolecular network after drug intervention; 2) matching modules of the biomolecular networks before and after drug intervention that indicate a change, and determining a pair of modules indicating a change; and 3) integrating topological parameters indicating different dimensions of the modules, combining weights of the topological parameters, constructing a comprehensive module evaluation system, and calculating an overall conformational change of the modules of the biomolecular networks before and after drug intervention. The present invention can be applied in the fields of bionetwork analysis, new drug design and development, pharmacological mechanism research, and the like.
(FR)L'invention concerne un procédé d'analyse quantitative, le procédé étant utilisé pour comparer quantitativement un degré de changement de modules de réseaux biomoléculaires avant et après une intervention par médicament. Le procédé intègre des paramètres topologiques de module ayant différentes dimensions (attributs), construit et quantifie un indice global et compréhensif de changement de module, et analyse et compare de manière quantitative le degré de changement des modules des réseaux biomoléculaires avant et après l'intervention par médicament. Le procédé consiste en : 1) la construction d'un réseau biomoléculaire avant une intervention par médicament et un réseau biomoléculaire après une intervention par médicament, et l'identification d'un module du réseau biomoléculaire avant l'intervention par médicament et un module du réseau biomoléculaire après l'intervention par médicament; 2) la mise en correspondance de modules des réseaux biomoléculaires avant et après une intervention par médicament qui indiquent un changement, et la détermination d'une paire de modules qui indiquent un changement; et 3) l'intégration de paramètres topologiques qui indiquent différentes dimensions des modules, la combinaison de poids des paramètres topologiques, la construction d'un système d'évaluation de module compréhensif, et le calcul d'un changement conformationnel global des modules des réseaux biomoléculaires avant et après l'intervention par médicament. La présente invention peut être appliquée dans les domaines de l'analyse de réseau biologique, de la nouvelle conception et du développement de médicaments, de la recherche de mécanismes pharmacologiques et analogues.
(ZH)一种定量分析方法,所述方法用于量化比较药物干预前后生物分子网络中模块的变化程度。所述方法整合模块不同维度(属性)的拓扑参数,构建量化模块变化的整体综合指标,定量分析比较药物干预前后生物分子网络中模块的变化程度。所述方法包括:1)分别构建药物干预前和药物干预后的生物分子网络,并分别进行模块的识别;2)匹配药物干预前和药物干预后的生物分子网络中变化的模块,确定变化模块对;3)整合表示模块不同维度的拓扑参数,结合所述拓扑参数的权值,构建模块综合评价体系,计算药物干预前后生物分子网络中模块整体构象的改变程度。可应用于生物网络分析、新药研发设计、药理机制研究等领域。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Chinese (ZH)
Filing Language: Chinese (ZH)