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1. (WO2018049026) SRM/MRM ASSAY FOR THE TUBULIN BETA-3 CHAIN (TUBB3) PROTEIN
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Pub. No.:    WO/2018/049026    International Application No.:    PCT/US2017/050472
Publication Date: 15.03.2018 International Filing Date: 07.09.2017
IPC:
G01N 33/68 (2006.01)
Applicants: EXPRESSION PATHOLOGY, INC. [US/US]; 9600 Medical Center Drive, Suite 300 Rockville, MD 20850 (US)
Inventors: HEMBROUGH, Todd; (US).
CECCHI, Fabiola; (US).
SCHWARTZ, Sarit; (US)
Agent: BOOTH, Paul M.; (US).
BOOTH, Paul, M.; (US).
DEBOY, Mark; (US).
EDELL, Ira, C.; (US).
ALDAG, Andrew, J.; (US)
Priority Data:
62/384,202 07.09.2016 US
62/402,984 30.09.2016 US
Title (EN) SRM/MRM ASSAY FOR THE TUBULIN BETA-3 CHAIN (TUBB3) PROTEIN
(FR) DOSAGE SRM/MRM POUR LA PROTÉINE DE LA CHAÎNE BÊTA -3 DE LA TUBULINE (TUBB3)
Abstract: front page image
(EN)The current disclosure provides for a specific peptide, and derived ionization characteristics of a peptide from the tubulin beta-3 chain protein (TUBB3) that is particularly advantageous for quantifying the TUBB3 protein directly in biological samples that have been fixed in formalin by the method of Selected Reaction Monitoring (SRM) mass spectrometry. A protein sample is prepared from a biological sample using the Liquid Tissue reagents and protocol and the TUBB3 protein is quantitated by SRM/MRM mass spectrometry analysis of the sample, where the specific peptide is quantitated. Methods of treatment are provided in which the measured level of TUBB3 in a patient tumor sample is compared with a reference level and the patient is treated with a taxane-based treatment regimen when the measured TUBB3 level is lower than the reference level. A suitable reference level is, for example, about 700 amol/μg tissue.
(FR)La présente invention concerne un peptide spécifique, et des caractéristiques d'ionisation dérivées d'un peptide à partir de la protéine de la chaîne bêta-3 de tubuline (TUBB3) qui est particulièrement avantageux pour quantifier la protéine TUBB3 directement dans des échantillons biologiques qui ont été fixés dans la formaline par le procédé de spectrométrie de masse en mode surveillance de réaction sélectionnée (SRM). Un échantillon de protéine est préparé à partir d'un échantillon biologique au moyen de réactifs et du protocole de tissu liquide et la protéine TUBB3 est quantifiée par analyse par spectrométrie de masse en mode SRM/MRM (surveillance de réaction sélectionnée/surveillance de réactions multiples) de l'échantillon, où le peptide spécifique est quantifié. L'invention concerne des procédés de traitement lors desquels le niveau mesuré de TUBB3 dans un échantillon de tumeur de patient est comparé à un niveau de référence et le patient est traité avec un régime de traitement à base de taxane lorsque le niveau de TUBB3 mesuré est inférieur au niveau de référence. Un niveau de référence approprié est, par exemple, environ 700 amol/μg de tissu.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)