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1. (WO2018034780) SEQUENCING METHOD FOR RAPID IDENTIFICATION AND PROCESSING OF COGNATE NUCLEOTIDE PAIRS
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Pub. No.:    WO/2018/034780    International Application No.:    PCT/US2017/042843
Publication Date: 22.02.2018 International Filing Date: 19.07.2017
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), G01N 21/45 (2006.01)
Applicants: OMNIOME, INC. [US/US]; 10575 Roselle Street San Diego, California 92121 (US)
Inventors: IYIDOGAN, Pinar; (US).
VIJAYAN, Kandaswamy; (US)
Agent: THOMAS, Tiffany B.; (US)
Priority Data:
62/375,389 15.08.2016 US
Title (EN) SEQUENCING METHOD FOR RAPID IDENTIFICATION AND PROCESSING OF COGNATE NUCLEOTIDE PAIRS
(FR) PROCÉDÉ DE SÉQUENÇAGE DESTINÉ À L'IDENTIFICATION ET AU TRAITEMENT RAPIDES DE PAIRES NUCLÉOTIDIQUES APPARENTÉES
Abstract: front page image
(EN)Provided are methods and systems for reducing the time needed for sequencing nucleic acids. The approach relies on detecting formation of nucleotidespecific ternary complexes comprising a polymerase (e.g., a DNA polymerizing enzyme), a primed template nucleic acid molecule, and a nucleotide complementary to the templated base of the primed template nucleic acid. The methods and systems facilitate determination of the next correct nucleotide, as well as the subsequent next correct nucleotide from a cycle of examining four different nucleotides without requiring chemical incorporation of any nucleotide into the primer.
(FR)La présente invention décrit des procédés et des systèmes de réduction du temps requis au séquençage d'acides nucléiques. L'approche repose sur la détection de la formation de complexes ternaires spécifiques à des nucléotides comprenant une polymérase (par exemple, une enzyme ADN polymérase), une molécule d'acide nucléique à matrice amorcée, et un nucléotide complémentaire de la base matrice de l'acide nucléique à matrice amorcée. Les procédés et les systèmes facilitent la détermination du nucléotide correct suivant, ainsi que le nucléotide correct suivant ultérieur à partir d'un cycle d'examen de quatre nucléotides différents sans nécessiter d'incorporation chimique de quelconque nucléotide dans l'amorce.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)