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1. (WO2018023068) METHODS AND COMPOSITIONS FOR PREVENTING CONCATEMERIZATION DURING TEMPLATE- SWITCHING
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Pub. No.:    WO/2018/023068    International Application No.:    PCT/US2017/044509
Publication Date: 01.02.2018 International Filing Date: 28.07.2017
IPC:
C12N 15/09 (2006.01), C12N 15/10 (2006.01), C12N 15/11 (2006.01), C12N 15/113 (2010.01), C12P 19/34 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: NEW ENGLAND BIOLABS, INC. [US/US]; 240 County Road Ipswich, MA 01938-2723 (US)
Inventors: GUAN, Shengxi; (US).
EVANS, Thomas, C., Jr.; (US).
NICHOLS, Nicole; (US).
BEI, Yanxia; (US)
Agent: KEDDIE, James, S.; (US)
Priority Data:
62/368,656 29.07.2016 US
62/370,469 03.08.2016 US
62/370,501 03.08.2016 US
15/240,166 18.08.2016 US
62/376,493 18.08.2016 US
Title (EN) METHODS AND COMPOSITIONS FOR PREVENTING CONCATEMERIZATION DURING TEMPLATE- SWITCHING
(FR) PROCÉDÉS ET COMPOSITIONS DESTINÉS À PRÉVENIR LA CONCATÉMÉRISATION PENDANT LA COMMUTATION DE MATRICE
Abstract: front page image
(EN)Compositions and methods for performing a template-switching reaction are provided that may include reducing or eliminating concatemerization of the template-switching oligonucleotide (TSO). In some embodiments, the composition may comprise a site-specific nucleic acid cleaving enzyme, a TSO that includes a recognition sequence for a site-specific nucleic acid cleaving enzyme, wherein the TSO has at its 3' end at least one nucleotide that is complementary to one or more non-templated nucleotides added to a templated cDNA strand by the reverse transcriptase, and a site-specific nucleic acid cleaving enzyme that cleaves the TSO at the recognition sequence.
(FR)L'invention porte sur des compositions et sur des procédés pour effectuer une réaction de commutation de matrice qui peuvent comprendre la réduction ou la suppression de la concatemérisation de l'oligonucléotide de commutation de matrice (TSO). Selon certains modes de réalisation, la composition peut comporter une enzyme de clivage d'acide nucléique spécifique d'un site, un TSO qui comprend une séquence de reconnaissance pour une enzyme de clivage d'acide nucléique spécifique d'un site, le TSO présentant à son extrémité 3' au moins un nucléotide qui est complémentaire d'un ou de plusieurs nucléotides non formés sur matrice ajoutés à un brin d'ADNc formé sur matrice par la transcriptase inverse, et une enzyme de clivage d'acide nucléique spécifique d'un site qui clive le TSO au niveau de la séquence de reconnaissance.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JO, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)