WIPO logo
Mobile | Deutsch | Español | Français | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Search International and National Patent Collections
World Intellectual Property Organization
Search
 
Browse
 
Translate
 
Options
 
News
 
Login
 
Help
 
Machine translation
1. (WO2017201112) HIGH THROUGHPUT METHOD FOR IDENTIFICATION AND SEQUENCING OF UNKNOWN MICROBIAL AND EUKARYOTIC GENOMES FROM COMPLEX MIXTURES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau    Submit observation

Pub. No.: WO/2017/201112 International Application No.: PCT/US2017/033008
Publication Date: 23.11.2017 International Filing Date: 17.05.2017
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01) ,C12N 15/10 (2006.01) ,C12Q 1/04 (2006.01) ,C12Q 1/24 (2006.01) ,G01N 33/50 (2006.01)
Applicants: SHORELINE BIOME, LLC[US/US]; 400 Farmington Avenue CB 119 Farmington, CT 06032, US
Inventors: DRISCOLL, Mark; US
JARVIE, Thomas; US
Agent: KOLINSKY, Monica, A.; US
Priority Data:
15/596,36616.05.2017US
62/337,50717.05.2016US
Title (EN) HIGH THROUGHPUT METHOD FOR IDENTIFICATION AND SEQUENCING OF UNKNOWN MICROBIAL AND EUKARYOTIC GENOMES FROM COMPLEX MIXTURES
(FR) PROCÉDÉ À HAUT RENDEMENT D'IDENTIFICATION ET DE SÉQUENÇAGE DE GÉNOMES MICROBIENS ET EUCARYOTES INCONNUS ISSUS DE MÉLANGES COMPLEXES
Abstract: front page image
(EN) Disclosed are methods for screening biological samples for the presence unknown microbes, such as bacteria and archaea or unknown eukaryotes using rRNA gene sequences or other highly conserved genetic regions, across multiple biological samples using a unique sequence tag (barcode) corresponding to the sample. The screening process tracks the unknown microbe or eukaryote in a diluted sample where the DNA has been prepared using whole genome amplification. The whole genome of the unknown microbe or eukaryote is then sequenced and assembled.
(FR) L'invention concerne des procédés de criblage d'échantillons biologiques pour détecter la présence de microbes inconnus, tels que des bactéries et des archées ou des eucaryotes inconnus au moyen de séquences de gènes d'ARNr ou d'autres régions génétiques fortement conservées, dans des échantillons biologiques multiples au moyen d'une étiquette de séquence (code à barres) unique correspondant à l'échantillon. Le procédé de criblage selon l'invention suit le microbe ou l'eucaryote inconnu dans un échantillon dilué où l'ADN a été préparé par amplification du génome entier. Le génome entier du microbe ou eucaryote inconnu est ensuite séquencé et assemblé.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Office (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)