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1. (WO2017189878) COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DETECTION OF NUCLEIC ACIDS
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Pub. No.:    WO/2017/189878    International Application No.:    PCT/US2017/029903
Publication Date: 02.11.2017 International Filing Date: 27.04.2017
IPC:
C07H 21/02 (2006.01), C07H 21/04 (2006.01), C12M 1/34 (2006.01)
Applicants: ROKA BIOSCIENCE, INC. [US/US]; 20 Independence Boulevard, 4th Floor Warren, NJ 07059 (US)
Inventors: BECKER, Michael, McClellan; (US)
Agent: DECAMP, James, D.; (US)
Priority Data:
62/328,510 27.04.2016 US
Title (EN) COMPOSITIONS AND METHODS FOR THE DETECTION OF NUCLEIC ACIDS
(FR) COMPOSITIONS ET PROCÉDÉS DE DÉTECTION D'ACIDES NUCLÉIQUES
Abstract: front page image
(EN)The present invention provides methods of detecting a target nucleic acid in a sample using a duplex-specific nuclease (DSN), such as Kamchatka crab nuclease or RNaseH, and compositions for DSN reactions. For example, a composition of the invention may include a sample having a target nucleic acid, a nucleic acid probe, a DSN, and a buffer, and the composition may be maintained at about 90°C to about 97°C. The target nucleic acid may be detected, for example, by hybridizing the target nucleic acid to a detection probe and digesting the resultant duplex using the duplex-specific nuclease, thus releasing a detectable component of the probe, which can be separated from unbound probe for detection or detected in situ. The invention also features methods of catalyzing hybridization or stabilizing hybridization between nucleic acid strands using DSNs. The methods and compositions described herein are therefore useful for rapid, efficient, sensitive, and accurate detection of target nucleic acids in a variety of applications, including, for example, diagnostic tests and laboratory assays.
(FR)La présente invention décrit des procédés de détection d'un acide nucléique cible dans un échantillon en utilisant une nucléase spécifique de double hélice (DSN), telle que la nucléase de crabe de Kamchatka ou ARNaseH, et des compositions pour les réactions DSN. Par exemple, une composition de l'invention peut comprendre un échantillon ayant un acide nucléique cible, une sonde acide nucléique, une DSN, et un tampon, et la composition peut être maintenue à environ 90 °C à environ 97 °C. L'acide nucléique cible peut être détecté, par exemple, par hybridation de l'acide nucléique cible à une sonde de détection et digestion de la double hélice résultante en utilisant la nucléase spécifique de double hélice, libérant ainsi un constituant détectable de la sonde, qui peut être séparé de la sonde non liée pour la détection ou détectée in situ. L'invention décrit également des procédés de catalyse d'hybridation ou de stabilisation de l'hybridation entre des brins d'acide nucléique en utilisant des DSN. Les procédés et les compositions décrits ci-inclus sont par conséquent utiles pour la détection rapide, efficace, sensible, et précise des acides nucléiques cibles dans une diversité d'applications, comprenant, par exemple, des tests de diagnostic et des essais de laboratoire.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)