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1. (WO2017189784) METHODS AND SYSTEMS FOR GENERATING FACTORY ORDER FORMS TO CONTROL PRODUCTION OF NUCLEOTIDE SEQUENCES
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Pub. No.: WO/2017/189784 International Application No.: PCT/US2017/029725
Publication Date: 02.11.2017 International Filing Date: 26.04.2017
IPC:
G06F 19/10 (2011.01) ,G06Q 10/06 (2012.01)
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
19
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific applications
10
Bioinformatics, i.e. methods or systems for genetic or protein-related data processing in computational molecular biology
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
Q
DATA PROCESSING SYSTEMS OR METHODS, SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL, SUPERVISORY OR FORECASTING PURPOSES; SYSTEMS OR METHODS SPECIALLY ADAPTED FOR ADMINISTRATIVE, COMMERCIAL, FINANCIAL, MANAGERIAL, SUPERVISORY OR FORECASTING PURPOSES, NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
10
Administration; Management
06
Resources, workflows, human or project management, e.g. organising, planning, scheduling or allocating time, human or machine resources; Enterprise planning; Organisational models
Applicants:
ZYMERGEN INC. [US/US]; 5980 Horton Street Suite 105 Emeryville, CA 94608, US
Inventors:
FREWEN, Barbara; US
KIMBALL, Aaron; US
PALCHICK, Zachary; US
Agent:
SALTZBERG, Robert A.; US
Priority Data:
15/140,29627.04.2016US
Title (EN) METHODS AND SYSTEMS FOR GENERATING FACTORY ORDER FORMS TO CONTROL PRODUCTION OF NUCLEOTIDE SEQUENCES
(FR) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES DE GÉNÉRATION DE FORMULAIRES DE COMMANDE D'USINE PERMETTANT DE COMMANDER LA PRODUCTION DE SÉQUENCES NUCLÉOTIDIQUES
Abstract:
(EN) The generation of a factory order to control production of nucleotide sequences by a gene manufacturing system includes receiving an expression indicating an operation on sequence operands, each representing at least one nucleotide sequence part, evaluating the expression to a sequence specification, wherein the sequence specification comprises a data structure including one or more first-level operations and one or more second-level operations, and generating the factory order based upon execution of the one or more first-level operations and the one or more second-level operations. In a recursive manner, the one or more first-level operations operate on at least one first-level sequence operand, the value of which is resolved by execution of one or more of the second-level operations. The factory order may then be provided to the gene manufacturing system to assemble the sequence parts into nucleotide sequences represented by the sequence specification.
(FR) La présente invention consiste à générer une commande d'usine permettant de commander la production de séquences nucléotidiques par un système de fabrication de gènes consistant à recevoir une expression indiquant une opération sur des opérandes de séquence, chacun représentant au moins une partie de séquence nucléotidique, à évaluer l'expression d'une spécification de séquence, la spécification de séquence comportant une structure de données comprenant une ou plusieurs opérations de premier niveau et une ou plusieurs opérations de second niveau, et à générer la commande d'usine sur la base de l'exécution desdites opérations de premier niveau et desdites opérations de second niveau. De manière récursive, lesdites opérations de premier niveau fonctionnent sur au moins un opérande de séquence de premier niveau, la valeur de ce dernier étant résolue par l'exécution d'une ou plusieurs opérations des opérations de second niveau. La commande d'usine peut ensuite être fournie au système de production de gènes pour assembler les parties de séquence en séquences nucléotidiques représentées par la spécification de séquence.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Office (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)