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1. (WO2017188669) METHOD FOR DETECTING TARGET NUCLEIC ACID SEQUENCE USING CLEAVED COMPLEMENTARY TAG FRAGMENT AND COMPOSITION THEREOF
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Pub. No.:    WO/2017/188669    International Application No.:    PCT/KR2017/004297
Publication Date: 02.11.2017 International Filing Date: 21.04.2017
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), G01N 27/62 (2006.01), G01N 30/72 (2006.01)
Applicants: GENEMATRIX INC. [KR/KR]; (Korea bio park B Dong, Sampyeong-dong) 8F, 7F, 700, Daewangpangyo-ro Bundang-gu, Seongnam-si Gyeonggi-do 13488 (KR)
Inventors: KIM, Soo Ok; (KR).
KIM, Suk Joon; (KR).
HONG, Sun Pyo; (KR).
CHUNG, Hyun Jae; (KR).
CHO, Woo Jae; (KR).
KIM, Jae Il; (KR).
YANG, Seung Min; (KR).
CHO, Ae Ri; (KR).
HONG, Seong Soo; (KR).
KIM, Jeong Woo; (KR).
JEONG, Sun Young; (KR)
Agent: KOO, Hyun-Seo; 9F, 8, Gangnam-daero 66-gil Gangnam-gu, Seoul 06253 (KR)
Priority Data:
10-2016-0050313 25.04.2016 KR
Title (EN) METHOD FOR DETECTING TARGET NUCLEIC ACID SEQUENCE USING CLEAVED COMPLEMENTARY TAG FRAGMENT AND COMPOSITION THEREOF
(FR) PROCÉDÉ DE DÉTECTION DE SÉQUENCE D'ACIDE NUCLÉIQUE CIBLE À L'AIDE D'UN FRAGMENT DE MARQUEUR COMPLÉMENTAIRE CLIVÉ ET COMPOSITION ASSOCIÉE
(KO) 절단된 상보적인 태그 절편을 이용한 표적 핵산 서열 검출 방법 및 그 조성물
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to a method and a composition for detecting a target nucleic acid sequence using a cleaved complementary tag fragment. Specifically, the present invention relates to a method for linking a complementary tag sequence to a PCR primer so that a marking can be produced by a restriction enzyme during a PCR reaction, diversifying the complementary tag sequence to be linked to each primer by utilizing factors such as length and nucleic acid combination, etc., and distinguishing the target sequence using the same. According to the present invention, a cleaved complementary tag fragment (CCTF) under stringent conditions is a complementary sequence to any sequence at the 5' end linked to the primer and cannot be formed unless a PCR reaction and a restriction enzyme reaction occur, and the cleaved single strand is formed only when hybridization to the target sequence occurs and a primer extension product complementary to the target sequence is formed, so as to have a higher degree of accuracy secured by reading the cleaved single strand. In addition, the CCTF can be used to identify a plurality of target nucleic acid sequences by selecting various analytical techniques and analysis equipment according to a user's intention. For example, a result can be confirmed rapidly and accurately in genetic testing, identification of organisms in a sample, diagnosis of microbial or viral infection, etc.
(FR)La présente invention concerne un procédé et une composition permettant de détecter une séquence d'acide nucléique cible à l'aide d'un fragment de marqueur complémentaire clivé. Plus particulièrement, la présente invention concerne un procédé de liaison d'une séquence de marqueur complémentaire à une amorce de PCR de sorte à pouvoir produire un marquage par une enzyme de restriction pendant une réaction de PCR, de diversification de la séquence de marqueur complémentaire à lier à chaque amorce en utilisant des facteurs tels que la longueur et la combinaison d'acides nucléiques, etc. et la différenciation de la séquence cible à l'aide de ceux-ci. Selon la présente invention, un fragment de marqueur complémentaire clivé (CCTF) dans des conditions strictes est une séquence complémentaire d'une séquence quelconque au niveau de l'extrémité 5' liée à l'amorce et ne peut pas être formé à moins qu'une réaction de PCR et qu'une réaction d'une enzyme de restriction ne se produisent, et le brin simple clivé n'est formé qu'après hybridation à la séquence cible et formation d'un produit d'extension d'amorce complémentaire de la séquence cible, de manière à obtenir un degré de précision supérieur acquis en lisant le brin simple clivé. De plus, le CCTF peut être utilisé pour identifier une pluralité de séquences d'acides nucléiques cibles en sélectionnant diverses techniques analytiques et un équipement d'analyse en fonction de l'intention de l'utilisateur. Par exemple, un résultat peut être confirmé rapidement et précisément au cours de dépistages génétiques, d'identification d'organismes dans un échantillon, de diagnostic d'infections microbiennes ou virales, etc.
(KO)본 발명은 절단된 상보적인 태그 절편을 이용한 표적 핵산 서열 검출 방법 및 그 조성물에 관한 것으로, 구체적으로 PCR 프라이머에 표지 상보적 서열을 연결하여 PCR 반응 중 제한효소에 의해 표식이 생성되도록 하며, 각 프라이머에 연결하는 표지 상보적 서열을 길이 및 핵산의 조합등의 요소를 활용하여 다양화하고, 이를 이용해 표적 서열을 구분하는 방법에 관한 것이다. 본 발명에 따르면 엄격한 조건하에서 Cleaved Complementary Tag Fragment (CCTF)는 프라이머에 연결된 5' 말단의 임의 서열과 상보적 서열로서 PCR 반응과 제한효소 반응이 일어나지 않으면 형성되지 않으며 표적 서열에 혼성화 및 표적 서열과 상보적인 프라이머 신장 산물을 형성한 경우에서만 절단된 단일가닥이 형성되어 이를 판독함으로서 보다 높은 정확성을 확보할 수 있다. 또한 CCTF는 다양한 분석기법 및 분석장비를 사용자 의도에 맞게 선택하여 다수의 표적 핵산 서열을 동정하는데 활용 할 수 있다. 이를테면 유전자 검사, 샘플 내의 생물체 동정, 미생물 또는 바이러스의 감염 여부 진단 등에서 신속하고 정확하게 결과를 확인할 수 있다.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
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Publication Language: Korean (KO)
Filing Language: Korean (KO)