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1. (WO2017180319) MIXED OPTICAL SIGNALS IN POLYMER ANALYSIS WITH NANOPORES
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Pub. No.:    WO/2017/180319    International Application No.:    PCT/US2017/024314
Publication Date: 19.10.2017 International Filing Date: 27.03.2017
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C40B 20/00 (2006.01)
Applicants: QUANTAPORE, INC. [US/US]; 1455 Adams Drive, Suite 1081 Menlo Park, California 94025 (US)
Inventors: ANDERSON, Brett N.; (US).
HUBER, Martin; (US).
MACEVICZ, Stephen C.; (US)
Agent: LEVINE, David A.; (US).
BAGADE, Sanjay S.; (US).
GALLAGHER, Laura L.; (US).
HAN, Johney U.; (US).
MCADAMS, Grant R.; (US).
XU, Daniel X.; (US)
Priority Data:
62/322,343 14.04.2016 US
Title (EN) MIXED OPTICAL SIGNALS IN POLYMER ANALYSIS WITH NANOPORES
(FR) SIGNAUX OPTIQUES MIXTES DANS UNE ANALYSE DE POLYMÈRE À L'AIDE DE NANOPORES
Abstract: front page image
(EN)The invention is directed to nanopore-based methods for analyzing polymers, such as polynucleotides or proteins, containing optical labels specific for different kinds of monomers. In some embodiments, methods of the invention include steps of (a) translocating a polymer through a nanopore, wherein different kinds of monomers of the polymer are labeled with different optical labels that generate distinguishable optical signals and wherein the nanopore constrains the monomers to move single file through an excitation zone that encompasses a plurality of monomers; (b) detecting a time-ordered set of optical signals from the monomers as the polymer passes through the excitation zone; (c) separating optical signals from different kinds of monomers to form monomer-specific time-ordered sets of optical signals; and (d) determining a sequence of monomers from the monomer-specific time-ordered sets of optical signals from the polymer.
(FR)L'invention concerne des procédés basés sur des nanopores pour analyser des polymères, tels que des polynucléotides ou des protéines, contenant des étiquettes optiques spécifiques à différents types de monomères. Dans certains modes de réalisation, les procédés de l'invention comprennent les étapes de (a) translocation d'un polymère à travers un nanopore, différents types de monomères du polymère étant étiquetés par des étiquettes optiques différentes qui génèrent des signaux optiques pouvant être distingués et le nanopore contraignant les monomères à se déplacer en une file unique à travers une zone d'excitation qui englobe une pluralité de monomères ; (b) détection d'un ensemble ordonné dans le temps de signaux optiques provenant des monomères à mesure que le polymère passe à travers la zone d'excitation ; (c) séparation des signaux optiques provenant de différents types de monomères pour former des ensembles de signaux optiques ordonnés dans le temps, spécifiques aux monomères ; et (d) détermination d'une séquence de monomères à partir des ensembles de signaux optiques ordonnés dans le temps, spécifiques aux monomères du polymère.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)