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1. (WO2017173356) POLYPEPTIDES CAPABLE OF FORMING HOMO-OLIGOMERS WITH MODULAR HYDROGEN BOND NETWORK-MEDIATED SPECIFICITY AND THEIR DESIGN
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Pub. No.: WO/2017/173356 International Application No.: PCT/US2017/025532
Publication Date: 05.10.2017 International Filing Date: 31.03.2017
IPC:
C07K 1/113 (2006.01) ,C07K 2/00 (2006.01) ,C07K 14/00 (2006.01) ,C07K 14/435 (2006.01) ,C07K 16/18 (2006.01) ,G01N 33/48 (2006.01)
Applicants: XU, Chunfu[US/US]; OM
BERMEO, Sherry[US/US]; US
LANGAN, Robert[US/US]; US
UNIVERSITY OF WASHINGTON[US/US]; 4545 Roosevelt Way NE, Suite 400 Seattle, WA 98105, US
Inventors: XU, Chunfu; OM
BERMEO, Sherry; US
LANGAN, Robert; US
BAKER, David; US
BOYKEN, Scott; US
CHEN, Zibo; US
Agent: HARPER, David, S.; US
Priority Data:
62/317,19001.04.2016US
Title (EN) POLYPEPTIDES CAPABLE OF FORMING HOMO-OLIGOMERS WITH MODULAR HYDROGEN BOND NETWORK-MEDIATED SPECIFICITY AND THEIR DESIGN
(FR) POLYPEPTIDES CAPABLES DE FORMER DES HOMO-OLIGOMÈRES AYANT UNE SPÉCIFICITÉ MÉDIÉE PAR DES RÉSEAUX DE LIAISONS HYDROGÈNE MODULAIRES ET LEUR CONCEPTION
Abstract: front page image
(EN) Methods and apparatus for identifying and screening hydrogen bond networks are provided. A computing device can determine a search space for hydrogen bond networks related to one or more molecules, where the search space can include a plurality of energy terms related to a plurality of residues related to the hydrogen bond networks. The computing device can search the search space to identify one or more hydrogen bond networks based on the plurality of energy terms. The computing device can screen the identified hydrogen bond networks to identity one or more screened hydrogen bond networks based on scores for the identified hydrogen bond networks. An output can be generated that is related to the one or more screened hydrogen bond networks. Also provided are polypeptides that can form homo-oligomers with modular hydrogen bond network-mediated specificity.
(FR) L'invention concerne des procédés et un appareil permettant d'identifier et de cribler des réseaux de liaisons hydrogène. Un dispositif informatique peut déterminer un espace de recherche de réseaux de liaisons hydrogène associés à une ou plusieurs molécules, l'espace de recherche pouvant comprendre une pluralité de termes d'énergie liés à une pluralité de résidus liés aux réseaux de liaisons hydrogène. Le dispositif informatique peut faire des recherches dans l'espace de recherche pour identifier un ou plusieurs réseaux de liaisons hydrogène sur la base de la pluralité de termes d'énergie. Le dispositif informatique peut cribler les réseaux de liaisons hydrogène identifiés pour identifier un ou plusieurs réseaux de liaisons hydrogène criblés sur la base de scores pour les réseaux de liaisons hydrogène identifiés. Un extrant qui est lié au ou aux réseaux de liaisons hydrogène criblés peut être générée. L'invention concerne également des polypeptides qui peuvent former des homo-oligomères ayant une spécificité médiée par des réseaux de liaisons hydrogène modulaires.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KH, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Office (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)