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1. (WO2017128497) SIMULATION GENERATION METHOD AND SYSTEM FOR METABOLISM MIXTURE MS/MS MASS SPECTRA
Latest bibliographic data on file with the International Bureau

Pub. No.: WO/2017/128497 International Application No.: PCT/CN2016/076226
Publication Date: 03.08.2017 International Filing Date: 14.03.2016
Chapter 2 Demand Filed: 27.05.2017
IPC:
G06F 19/12 (2011.01)
G PHYSICS
06
COMPUTING; CALCULATING; COUNTING
F
ELECTRIC DIGITAL DATA PROCESSING
19
Digital computing or data processing equipment or methods, specially adapted for specific applications
10
Bioinformatics, i.e. methods or systems for genetic or protein-related data processing in computational molecular biology
12
for modelling or simulation in systems biology, e.g. probabilistic or dynamic models, gene-regulatory networks, protein interaction networks or metabolic networks
Applicants:
哈尔滨工业大学深圳研究生院 HARBIN INSTITUTE OF TECHNOLOGY SHENZHEN GRADUATE SCHOOL [CN/CN]; 中国广东省深圳市 南山区深圳大学城哈工大园区 HIT Campus The University Town of Shenzhen, Nanshan District Shenzhen, Guangdong 518055, CN
周家锐 ZHOU, Jiarui [CN/CN]; CN
纪震 JI, Zhen [CN/CN]; CN
殷夫 YIN, Fu [CN/CN]; CN
朱泽轩 ZHU, Zexuan [CN/CN]; CN
Inventors:
周家锐 ZHOU, Jiarui; CN
纪震 JI, Zhen; CN
殷夫 YIN, Fu; CN
朱泽轩 ZHU, Zexuan; CN
Agent:
深圳市君胜知识产权代理事务所 JOHNSON INTELLECTUAL PROPERTY AGENCY (SHENZHEN); 中国广东省深圳市 南山区麒麟路1号南山科技创业服务中心308、309 Room 308-309 Knowledge Service Building No. 1 Qilin Road, Nanshan District Shenzhen, Guangdong 518052, CN
Priority Data:
201610049964.425.01.2016CN
Title (EN) SIMULATION GENERATION METHOD AND SYSTEM FOR METABOLISM MIXTURE MS/MS MASS SPECTRA
(FR) PROCÉDÉ ET SYSTÈME DE GÉNÉRATION DE SIMULATIONS POUR SPECTRES DE MASSE MS/MS DE MÉLANGE DE MÉTABOLISMES
(ZH) 一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统
Abstract:
(EN) A simulation generation method and system for metabolism mixture MS/MS mass spectra, not dependent on a real experiment. A large number of required metabolism mixture MS/MS simulation mass spectra can be generated by modifying parameter settings, and the amount of samples is not limited by an acquisition condition. In addition, when the conditions and an environment change, there is also no need to make a new design and conduct an experiment, helpful for improving the research and development efficiency of metabolomics. According to the method, a non-linear regression model is used for generating the MS/MS simulation mass spectra, and the problem relating to accuracy caused by simple linear superposition in a traditional algorithm is avoided. In addition, a noise probability model is built by making statistics of real metabolism mass spectrum data, and a complex interference situation needing to be taken account of in realistic applications is covered. The generated mass spectrum data is more practical, can effectively guide the early research and development of metabolomics, and can be partially used for verifying the algorithm performance.
(FR) L’invention concerne un procédé et un système de génération de simulation pour spectres de masse MS/MS de mélange de métabolismes, indépendants de l’expérience réelle. Un grand nombre de spectres de masse exigés pour la simulation MS/MS de mélange de métabolismes peut être générée par modification de valeurs de paramètres, et le nombre d’échantillons n’est pas limité par une condition d’acquisition. De plus, lorsque les conditions et un environnement changent, il n’est pas non plus nécessaire d’effectuer une nouvelle conception et de mener une expérience, ce qui est utile pour améliorer l’efficacité de la recherche et du développement de la métabolomique. Selon le procédé, un modèle de régression non linéaire est utilisé pour générer des spectres de masse de simulation MS/MS, ce qui évite d’être confronté au problème de précision dû à la superposition linéaire simple qu’effectuent les algorithmes conventionnels. De plus, un modèle de probabilité de bruit est créé par la réalisation de statistiques sur les données de spectre de masse du métabolisme réel, et une situation d’interférence complexe devant être prise en compte dans des applications réalistes est traitée. Les données de spectre de masse générées sont plus pratiques, elles permettent de guider efficacement la recherche et le développement naissants de la métabolomique, et peuvent être utilisées en partie pour vérifier les performances des algorithmes.
(ZH) 一种代谢混合物MS/MS质谱的仿真生成方法及系统,其不依赖于真实实验,可通过修改参数设定,大量产生所需的代谢混合物MS/MS仿真质谱,样本量不受采集条件限制。此外,当条件与环境变动时,也无需重新设计并进行实验;有助于提升代谢组学的研发效率。本方法使用非线性回归模型生成MS/MS仿真质谱,避免了传统算法中简单线性叠加所带来的准确性问题。此外,通过统计真实代谢质谱数据建立噪声概率模型,涵盖了现实应用中需要面临的复杂干扰情况。所生成的质谱数据更符合实际,可有效指导代谢组学的前期研发,并部分用于算法性能的验证。
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Publication Language: Chinese (ZH)
Filing Language: Chinese (ZH)