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1. (WO2017067868) PERFORMING SEGMENTATION OF CELLS AND NUCLEI IN MULTICHANNEL IMAGES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2017/067868    International Application No.:    PCT/EP2016/074827
Publication Date: 27.04.2017 International Filing Date: 17.10.2016
IPC:
G06T 7/00
Applicants: VENTANA MEDICAL SYSTEMS, INC. [US/US]; 1910 Innovation Park Dr. Tucson, Arizona 85755 (US).
F. HOFFMANN-LA ROCHE AG [CH/CH]; Grenzacherstrasse 124 4070 Basel (CH) (CL only)
Inventors: WANG, Xiuzhong; (US)
Agent: GOEHRING, Frank; (DE).
BURGER, Alexander; (DE).
JENNI, Wolfgang; (DE).
HILDEBRANDT, Martin; (DE).
MISERA, Simon; (DE).
NASER, Werner; (DE).
SKOLAUT, Alexander; (DE).
EISENMANN, Ulrike; (DE).
MERTES, Maria; (DE)
Priority Data:
62/243,536 19.10.2015 US
Title (EN) PERFORMING SEGMENTATION OF CELLS AND NUCLEI IN MULTICHANNEL IMAGES
(FR) RÉALISATION D'UNE SEGMENTATION DE CELLULES ET DE NOYAUX DANS DES IMAGES MULTICANAL
Abstract: front page image
(EN)Systems and methods of improving segmentation and classification in multi-channel images of biological specimens are described herein. Image channels may be arranged and processed sequentially, with the first image channel being processed from an unmodified image, and subsequent images processed from attenuated images that remove features of previous segmentations. For each segmented image channel in sequence, a binary image mask of the image channel may be created. A distance transform image may be computed from the binary mask. Attenuation images computed for all previous channels may be combined with a current attenuation image to create a combined attenuation image. The next image channel in the sequence may then be attenuated to produce an attenuated next image channel, which may then be segmented. The steps can be repeated until all image channels have been segmented.
(FR)La présente invention concerne des systèmes et des procédés permettant d'améliorer la segmentation et la classification dans des images multicanal de spécimens biologiques. Des canaux d'image peuvent être agencés et traités de manière séquentielle, le premier canal d'image étant traité à partir d'une image non modifiée et des images ultérieures étant traitées à partir d'images atténuées, qui éliminent des caractéristiques de segmentations précédentes. Pour chaque canal d'image segmentée en séquence, un masque d'image binaire du canal d'image peut être créé. Une image de transformée de distance peut être calculée à partir du masque binaire. Des images d'atténuation calculées pour tous les canaux précédents peuvent être combinées avec une image d'atténuation actuelle afin de créer une image d'atténuation combinée. Le canal d'image suivant dans la séquence peut alors être atténué de sorte à produire un prochain canal d'image atténué, qui peut alors être segmenté. Les étapes peuvent être répétées jusqu'à ce que tous les canaux d'image aient été segmentés.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)