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1. (WO2017061128) METHOD AND KIT FOR CONCENTRATION OF TARGET DOUBLE-STRANDED NUCLEIC ACID MOLECULES USING PYRROLE-IMIDAZOLE POLYAMIDE
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2017/061128    International Application No.:    PCT/JP2016/004530
Publication Date: 13.04.2017 International Filing Date: 07.10.2016
IPC:
C12N 15/09 (2006.01), C07H 21/04 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: TOPPAN PRINTING CO., LTD. [JP/JP]; 5-1, Taito 1-chome, Taito-ku, Tokyo 1100016 (JP)
Inventors: NAGASE, Hiroki; (JP).
TSUKAMOTO, Kei; (JP).
KITANO, Shiro; (JP)
Agent: TANI & ABE, P.C.; 6-20, Akasaka 2-chome, Minato-ku, Tokyo 1070052 (JP)
Priority Data:
2015-200599 08.10.2015 JP
Title (EN) METHOD AND KIT FOR CONCENTRATION OF TARGET DOUBLE-STRANDED NUCLEIC ACID MOLECULES USING PYRROLE-IMIDAZOLE POLYAMIDE
(FR) PROCÉDÉ ET TROUSSE DE CONCENTRATION DE MOLÉCULES D’ACIDE NUCLÉIQUE DOUBLE BRIN CIBLES UTILISANT DU POLYAMIDE PYRROLE-IMIDAZOLE
(JA) ピロールイミダゾール含有ポリアミドを用いた標的二本鎖核酸分子の濃縮方法およびキット
Abstract: front page image
(EN)The present invention provides a method and kit for the concentration of target double-stranded nucleic acid molecules by using a pyrrole-imidazole polyamide (PI polyamide) to identify differences of one or more bases between the base sequences of the target double-stranded nucleic acid molecules and non-target double-stranded nucleic acid molecules, and specifically trapping the target double-stranded nucleic acid molecules or removing the non-target double-stranded nucleic acid molecules. The method for the concentration of target double-stranded nucleic acid molecules by separating the target double-stranded nucleic acid molecules from non-target double-stranded nucleic acid molecules includes: a step for forming a mixed solution in which a PI polyamide modified with a linker molecule that specifically bonds to a sequence specific to the target double-stranded nucleic acid molecules is mixed with a carrier modified with a ligand molecule that specifically bonds to the linker molecule; a step for forming a complex A in which the carrier is further bonded the PI polyamide in a complex a1 obtained by the bonding of the PI polyamide and the target double-stranded nucleic acid molecules in the mixed solution; and a step for separating and recovering the complex A from the mixed solution.
(FR)La présente invention concerne un procédé et une trousse de concentration de molécules d’acide nucléique double brin cibles utilisant un polyamide pyrrole-imidazole (polyamide PI) pour identifier des différences d’une ou plusieurs bases entre les séquences de base des molécules d’acide nucléique double brin cibles et des molécules d’acide nucléique double brin non-cibles, et spécifiquement le piégeage des molécules d’acide nucléique double brin cibles ou l’élimination des molécules d’acide nucléique double brin non-cibles. La présente invention décrit le procédé de concentration des molécules d’acide nucléique double brin cibles en séparant les molécules d’acide nucléique double brin cibles des molécules d’acide nucléique double brin non-cibles incluant : une étape de formation d’une solution mixte dans laquelle un polyamide PI modifié avec une molécule liante qui se lie spécifiquement à une séquence spécifique des molécules d’acide nucléique double brin cibles est mélangé avec un vecteur modifié avec une molécule ligand qui se lie spécifiquement à la molécule liante ; une étape de formation d’un complexe A dans laquelle le vecteur est en outre lié au polyamide PI dans un complexe a1 obtenu par la liaison du polyamide PI et des molécules d’acide nucléique double brin cibles dans la solution mixte ; et une étape de séparation et de récupération du complexe A de la solution mixte.
(JA)本発明では、ピロールイミダゾール含有ポリアミド(PIポリアミド)を用いて、非標的二本鎖核酸分子と標的二本鎖核酸分子の塩基配列の1塩基以上の違いを識別して、標的二本鎖核酸分子を特異的に捕捉または非標的二本鎖核酸分子を除去し、標的二本鎖核酸分子を濃縮する方法及びキットを提供する。前記標的二本鎖核酸分子を非標的二本鎖核酸分子から分離して濃縮する方法は、前記標的二本鎖核酸分子の特定の配列に特異的に結合するリンカー分子で修飾されたPIポリアミドと、前記リンカー分子と特異的に結合するリガンド分子で修飾された担持体とを混合して混合溶液とする工程と、前記混合溶液中の前記標的二本鎖核酸分子と前記PIポリアミドとが結合した複合体aの該PIポリアミドにさらに前記担持体を結合させた複合体Aを形成する工程と、前記混合溶液から、前記複合体Aを分離して回収する工程を含む。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DJ, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, KE, KG, KN, KP, KR, KW, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)