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1. (WO2017038682) METHOD FOR ANALYZING TEMPLATE NUCLEIC ACID, METHOD FOR ANALYZING TARGET MATERIAL, KIT FOR ANALYZING TEMPLATE NUCLEIC ACID OR TARGET MATERIAL, AND DEVICE FOR ANALYZING TEMPLATE NUCLEIC ACID OR TARGET MATERIAL
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Pub. No.: WO/2017/038682 International Application No.: PCT/JP2016/074976
Publication Date: 09.03.2017 International Filing Date: 26.08.2016
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01) ,C12M 1/00 (2006.01) ,G01N 21/64 (2006.01) ,C12N 15/09 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
M
APPARATUS FOR ENZYMOLOGY OR MICROBIOLOGY
1
Apparatus for enzymology or microbiology
G PHYSICS
01
MEASURING; TESTING
N
INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
21
Investigating or analysing materials by the use of optical means, i.e. using infra-red, visible, or ultra-violet light
62
Systems in which the material investigated is excited whereby it emits light or causes a change in wavelength of the incident light
63
optically excited
64
Fluorescence; Phosphorescence
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
N
MICRO-ORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICRO-ORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
15
Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
09
Recombinant DNA-technology
Applicants:
国立研究開発法人理化学研究所 RIKEN [JP/JP]; 埼玉県和光市広沢2番1号 2-1, Hirosawa, Wako-shi, Saitama 3510198, JP
株式会社ダナフォーム KABUSHIKI KAISHA DNAFORM [JP/JP]; 神奈川県横浜市鶴見区小野町75-1 75-1, Ono-cho, Tsurumi-ku, Yokohama-shi, Kanagawa 2300046, JP
Inventors:
田中 佑治 TANAKA Yuji; JP
林崎 良英 HAYASHIZAKI Yoshihide; JP
辻丸 光一郎 TSUJIMARU Koichiro; JP
Agent:
特許業務法人特許事務所サイクス SIKS & CO.; 東京都中央区京橋一丁目8番7号 京橋日殖ビル8階 8th Floor, Kyobashi-Nisshoku Bldg., 8-7, Kyobashi 1-chome, Chuo-ku, Tokyo 1040031, JP
Priority Data:
2015-16983328.08.2015JP
2016-09699813.05.2016JP
Title (EN) METHOD FOR ANALYZING TEMPLATE NUCLEIC ACID, METHOD FOR ANALYZING TARGET MATERIAL, KIT FOR ANALYZING TEMPLATE NUCLEIC ACID OR TARGET MATERIAL, AND DEVICE FOR ANALYZING TEMPLATE NUCLEIC ACID OR TARGET MATERIAL
(FR) PROCÉDÉ D'ANALYSE D'ACIDE NUCLÉIQUE UTILISÉ COMME GABARIT, PROCÉDÉ D'ANALYSE DE SUBSTANCE CIBLE, KIT D'ANALYSE D'ACIDE NUCLÉIQUE UTILISÉ COMME GABARIT OU DE SUBSTANCE CIBLE, ET DISPOSITIF D'ANALYSE D'ACIDE NUCLÉIQUE UTILISÉ COMME GABARIT OU DE SUBSTANCE CIBLE
(JA) 鋳型核酸の分析方法、標的物質の分析方法、鋳型核酸または標的物質の分析用キット、および鋳型核酸または標的物質の分析用装置
Abstract:
(EN) This method for analyzing a template nucleic acid includes: a fractionation step for fractionating a sample including a template nucleic acid; an amplification step for amplifying a target sequence and a complementary sequence thereof in the template nucleic acid in the presence of a nucleic acid-amplifying reagent; a detection step for detecting the generation or loss of a signal which indicates the amplification of the target sequence or the complementary sequence; and a determination step for determining the fraction of the template nucleic acid in which the generation or loss of the signal indicating the amplification has been detected, as an amplified fraction in which the target sequence or the complementary sequence is amplified. The nucleic acid-amplifying reagent includes a set of primers for amplifying the target sequence or the complementary sequence and a signal generating material by which a signal is generated or lost via the amplification, wherein the signal is generated when the signal generating material is in a sequence-dependent binding state and lost when the signal generating material is in an unbound state; or the signal is lost when the signal generating material is in a sequence-dependent binding state and generated when the signal generating material is in an unbound state; and the generation and loss of the signal are reversible.
(FR) La présente invention concerne un procédé d'analyse d'un acide nucléique utilisé comme gabarit comprenant : une étape de fractionnement destinée à fractionner un échantillon comprenant un acide nucléique utilisé comme gabarit; une étape d'amplification destinée à amplifier une séquence cible et une séquence complémentaire associée dans l'acide nucléique utilisé comme gabarit en présence d'un réactif d'amplification d'acide nucléique; une étape de détection destinée à détecter la génération ou la perte d'un signal qui indique l'amplification de la séquence cible ou de la séquence complémentaire; et une étape de détermination destinée à déterminer la fraction de l'acide nucléique utilisé comme gabarit dans laquelle a été détectée la génération ou la perte du signal indiquant l'amplification, en tant que fraction amplifiée dans laquelle est amplifiée la séquence cible ou la séquence complémentaire. Le réactif d'amplification d'acide nucléique comprend un ensemble d'amorces destinées à amplifier la séquence cible ou la séquence complémentaire et une substance génératrice de signal grâce à laquelle un signal est généré ou perdu par l'intermédiaire de l'amplification, le signal étant généré lorsque la substance génératrice de signal se trouve dans un état de liaison dépendant d'une séquence et perdu lorsque la substance génératrice de signal se trouve dans un état non lié; ou le signal étant perdu lorsque la substance génératrice de signal se trouve dans un état de liaison dépendant d'une séquence et généré lorsque la substance génératrice de signal se trouve dans un état non lié; et la génération et la perte du signal étant réversibles.
(JA) 本発明の鋳型核酸の分析方法は、鋳型核酸を含むサンプルの分画工程と、核酸増幅試薬の存在下、前記鋳型核酸における標的配列およびその相補配列の増幅を行う増幅工程と、前記標的配列または前記相補配列の増幅を示すシグナルの発生または消失を検出する検出工程と、前記増幅を示すシグナルの発生または消失が検出された鋳型核酸のフラクションを、前記標的配列または前記相補配列が増幅された増幅フラクションであると判別する判別工程とを含み、前記核酸増幅試薬は、前記標的配列および前記相補配列を増幅するプライマーセットと、前記増幅によりシグナルを発生または消失するシグナル発生物質とを含み、前記シグナル発生物質が、配列依存的に結合した状態で、シグナルを発生し、未結合の状態で、シグナルを消失する、または、配列依存的に結合した状態で、シグナルを消失し、未結合の状態で、シグナルを発生し、且つシグナルの発生と消失とが可逆的であることを特徴とする。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW
African Regional Intellectual Property Organization (ARIPO) (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Office (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (EPO) (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG)
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)