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1. (WO2017035662) MODIFIERS OF CFTR-DIRECTED THERAPY
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Pub. No.: WO/2017/035662 International Application No.: PCT/CA2016/051044
Publication Date: 09.03.2017 International Filing Date: 02.09.2016
IPC:
G01N 33/48 (2006.01) ,A61K 31/4245 (2006.01) ,A61K 31/44 (2006.01) ,A61K 31/47 (2006.01) ,A61K 48/00 (2006.01) ,C07D 213/75 (2006.01) ,C07D 215/56 (2006.01) ,C07D 271/06 (2006.01) ,C12Q 1/02 (2006.01) ,C12Q 1/68 (2006.01) ,G01N 33/50 (2006.01) ,G01N 33/53 (2006.01) ,C07K 14/705 (2006.01)
[IPC code unknown for G01N 33/48][IPC code unknown for A61K 31/4245][IPC code unknown for A61K 31/44][IPC code unknown for A61K 31/47][IPC code unknown for A61K 48][IPC code unknown for C07D 213/75][IPC code unknown for C07D 215/56][IPC code unknown for C07D 271/06][IPC code unknown for C12Q 1/02][IPC code unknown for C12Q 1/68][IPC code unknown for G01N 33/50][IPC code unknown for G01N 33/53][IPC code unknown for C07K 14/705]
Applicants:
THE HOSPITAL FOR SICK CHILDREN [CA/CA]; 555 University Avenue Toronto, Ontario M5G 1X8, CA
THE GOVERNING COUNCIL OF THE UNIVERSITY OF TORONTO [CA/CA]; Banting Institute, 100 College Street, Suite 413 Toronto, Ontario M5G 1L5, CA
Inventors:
ROMMENS, Johanna, M; CA
STRUG, Lisa; CA
SUN, Lei; CA
Agent:
BOOCOCK, Graeme; CA
ALLARD, Louis; CA
BEHMANN, Curtis B.; CA
COGHLAN, Jeffrey; CA
COLLARD, Christine J.; CA
CONN, David L.; CA
DE KLEINE, Geoffrey; CA
EVENSON, Brandon; CA
FRITZ, Joachim T.; CA
GORDON, Jeffrey Keith; CA
HOWG, Jason L.; CA
HUNG, Shin; CA
JOHNSON, Richard; CA
KEELER, Todd; CA
MARSMAN, Kathleen E.; CA
MUELLER-NEUHAUS, Jason; CA
NAUMAN, David; CA
PUNDSACK, Scott R.; CA
RAOUL, Jennifer M.; CA
SILVER, Gail C.; CA
SOJONKY, Andrew D.; CA
VICKERS, Mark, F.; CA
WEBB, Tim E.; CA
WOOD, David; CA
ZIMMERMAN, Gordon J.; CA
Priority Data:
62/213,39902.09.2015US
Title (EN) MODIFIERS OF CFTR-DIRECTED THERAPY
(FR) MODIFICATEURS DE THÉRAPIE DIRIGÉE CONTRE CFTR
Abstract:
(EN) Described herein is a genetic modifier of cystic fibrosis (CF), which may serve as a predictor of the efficacy of a CFTR-directed therapy. SNPs rs7512462 or rs2869027 in non-coding regions of SLC26A9 are shown to correlate with CF lung disease severity in patients having CFTR mutations that leave protein at the cell surface, e.g. gating mutations such as G551D. It is also shown that patient response to Ivacaftor correlates with SLC26A9 genotype. Given the biology of SLC26A9, risk alleles of SLC26A9 should correlate with reduced SLC26A9. SLC26A9 activity (marked by e.g. genotype or expression level) is therefore a predictor of treatment efficacy for any CFTR-directed therapeutic, such as Ivacaftor or Lumacaftor. Associated methods of selecting and treating patients are described, along with related kits, uses, and drug discovery platforms.
(FR) La présente invention concerne un modificateur génétique de la fibrose kystique (CF), qui peut servir de prédicteur de l'efficacité d'une thérapie dirigée contre CFTR. Il est démontré que les SNP rs7512462 ou rs2869027 dans des régions non codantes de SLC26A9 sont corrélées avec la gravité de la maladie pulmonaire CF chez des patients présentant des mutations de CFTR qui laissent la protéine à la surface cellulaire, par exemple des mutations de déclenchement telles que G551D. Il est également démontré qu'une réponse d'un patient à Ivacaftor est corrélée au génotype SLC26A9. Compte tenu de la biologie de SLC26A9, les allèles à risque de SLC26A9 devraient être corrélés à une réduction de SLC26A9. L'activité de SLC26A9 (marquée par, par exemple, le génotype ou le taux d'expression) est, par conséquent, un prédicteur de l'efficacité d'un traitement pour un agent thérapeutique dirigé contre CFTR, tel que Ivacaftor ou Lumacaftor. L'invention concerne en outre des procédés associés de sélection et de traitement de patients, ainsi que des kits, des utilisations et des plate-formes de découverte de médicaments associées.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)