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1. (WO2017033087) RAPID SCORING OF LC-MS/MS PEPTIDE DATA
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.: WO/2017/033087 International Application No.: PCT/IB2016/054867
Publication Date: 02.03.2017 International Filing Date: 12.08.2016
IPC:
G01N 33/68 (2006.01) ,H01J 49/00 (2006.01)
G PHYSICS
01
MEASURING; TESTING
N
INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
33
Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/-G01N31/131
48
Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
50
Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
68
involving proteins, peptides or amino acids
H ELECTRICITY
01
BASIC ELECTRIC ELEMENTS
J
ELECTRIC DISCHARGE TUBES OR DISCHARGE LAMPS
49
Particle spectrometers or separator tubes
Applicants:
DH TECHNOLOGIES DEVELOPMENT PTE. LTD. [SG/SG]; 33 Marsiling Industrial Estate Road 3, #04-06 Singapore 739256, SG
Inventors:
SHILOV, Ignat V.; US
TATE, Stephen A.; CA
Priority Data:
62/210,69527.08.2015US
Title (EN) RAPID SCORING OF LC-MS/MS PEPTIDE DATA
(FR) ÉVALUATION RAPIDE DE DONNÉES DE PEPTIDE LC-MS/MS
Abstract:
(EN) A plurality of product ion spectra measured over plurality of cycles for each precursor ion mass selection window of two or more precursor ion mass selection windows are received from a tandem mass spectrometer. A product ion extracted ion chromatograms (XIC) is calculated for each precursor ion mass selection window of the two or more precursor ion mass selection windows from the plurality of product ion spectra for each precursor ion mass selection window. Two or more product ion XICs are produced. A two-dimensional binary bit matrix is generated to represent each product ion XIC of the two or more product ion XICs. For each XIC of the two or more product ion XICs, the binary bit matrix is separately initialized with binary values calculated from each XIC and the initialized binary bit matrix is compared with stored information about known compounds to identify known compounds of each XIC.
(FR) La présente invention concerne une pluralité de spectres d'ions produits mesurés sur une pluralité de cycles pour chaque fenêtre de sélection de masse d'ions précurseurs d'au moins deux fenêtres de sélection de masse d'ions précurseurs, lesdits spectres étant reçus d'un spectromètre de masse en tandem. Un chromatogramme d'ions extraits (XIC) d'ions produits est calculé pour chaque fenêtre de sélection de masse d'ions précurseurs des deux, ou plus, fenêtres de sélection de masse d'ions précurseurs à partir de la pluralité de spectres d'ions produits pour chaque fenêtre de sélection de masse d'ions précurseurs. Au moins deux chromatogrammes XIC d'ions produits sont produits. Une matrice de bits binaire à deux dimensions est générée pour représenter chaque chromatogramme XIC d'ions produits des deux, ou plus, chromatogrammes XIC d'ions produits. Pour chaque chromatogramme XIC des deux, ou plus, chromatogrammes XIC d'ions produits, la matrice de bits binaires est séparément initialisée avec des valeurs binaires calculées à partir de chaque chromatogramme XIC et la matrice de bits binaires initialisée est comparée à des informations stockées concernant des composés connus pour identifier des composés connus de chaque chromatogramme XIC.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)