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1. (WO2016168351) ROBUST QUANTIFICATION OF SINGLE MOLECULES IN NEXT-GENERATION SEQUENCING USING NON-RANDOM COMBINATORIAL OLIGONUCLEOTIDE BARCODES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2016/168351    International Application No.:    PCT/US2016/027356
Publication Date: 20.10.2016 International Filing Date: 13.04.2016
IPC:
C12N 15/10 (2006.01), C12N 15/11 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: THE BOARD OF TRUSTEES OF THE LELAND STANFORD JUNIOR UNIVERSITY [US/US]; Office of the General Counsel P.O. Box P.O. Box 20386 Building 170, 3rd Floor, Main Quad Stanford, California 94305-2038 (US)
Inventors: LAU, Billy Tsz Cheong; (US).
JI, Hanlee P.; (US)
Agent: KEDDIE, James S.; (US)
Priority Data:
62/148,047 15.04.2015 US
Title (EN) ROBUST QUANTIFICATION OF SINGLE MOLECULES IN NEXT-GENERATION SEQUENCING USING NON-RANDOM COMBINATORIAL OLIGONUCLEOTIDE BARCODES
(FR) QUANTIFICATION ROBUSTE DE MOLÉCULES SIMPLES DANS LE CADRE D'UN SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION UTILISANT DES CODES À BARRES OLIGONUCLÉOTIDIQUES COMBINATOIRES NON ALÉATOIRES
Abstract: front page image
(EN)A population of nucleic acid adaptors is provided. In some embodiments, the population contains at least 50,000 different molecular barcode sequences, where the barcode sequences are double-stranded and at least 90% of the barcode sequences have an edit distance of at least 2. In certain cases, the adaptor may have an end in which the top and bottom strands are not complementary (i.e., may be in the form of a Y-adaptor). In some embodiments and depending on the how the adaptor is going to be employed, the other end of the adaptor may have a ligatable end or may be a transposon end sequence.
(FR)La présente invention concerne une population d'adaptateurs d'acide nucléique. Dans certains modes de réalisation, ladite population contient au moins 50 000 séquences de codes à barres moléculaires différentes, les séquences de codes à barres étant à double brin et au moins 90 % des séquences de codes à barres ayant une distance d'édition d'au moins 2. Dans certains cas, l'adaptateur peut avoir une extrémité dans laquelle les brins supérieur et inférieur ne sont pas complémentaires, c'est-à-dire, qu'il peut être en forme de Y. Dans certains modes de réalisation, et selon la manière dont l'adaptateur est destiné à être utilisé, l'autre extrémité de l'adaptateur peut avoir une extrémité ligaturable ou peut être une séquence d'extrémité de transposon.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)