WIPO logo
Mobile | Deutsch | Español | Français | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Search International and National Patent Collections
World Intellectual Property Organization
Search
 
Browse
 
Translate
 
Options
 
News
 
Login
 
Help
 
Machine translation
1. (WO2016093838) ENRICHMENT OF TARGET SEQUENCES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2016/093838    International Application No.:    PCT/US2014/069754
Publication Date: 16.06.2016 International Filing Date: 11.12.2014
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12N 15/10 (2006.01)
Applicants: NEW ENGLAND BIOLABS, INC. [US/US]; 240 County Road Ipswich, MA 01938 (US).
DIRECTED GENOMICS, LLC [--/US]; 3454 Charity Lane Toney, AL 35773 (US)
Inventors: RICHARD, Cynthia, L.; (US)
Agent: STRIMPEL, Harriet, M.; (US)
Priority Data:
Title (EN) ENRICHMENT OF TARGET SEQUENCES
(FR) ENRICHISSEMENT EN SÉQUENCES CIBLES
Abstract: front page image
(EN)Methods and compositions are provided for enriching for target sequences from a population of nucleic acids, that includes: combining in solution, a population of nucleic acids and a target isolation probe wherein the target isolation probe comprises an affinity binding domain; permitting a single stranded region of the target isolation probe to hybridize to all or a portion of a target sequence in the population of nucleic acids; selectively immobilizing the hybridized nucleic acids from the population containing the target sequences by associating the target isolation probe with a capture domain and removing unbound material; removing non-target sequences from the 3' end of the target sequence by means of one or more 3' exonucleases thereby generating a blunt ended duplex or a staggered end at the 3' end of the target sequence; optionally ligating a 3' duplex adaptor or a duplex end of a hairpin adaptor to the 3' end of the target sequence and the 5' end of the target isolation probe; extending the 3' end of the target isolation probe to form a blunt end or a staggered end at the 5' end of the target sequence suitable for ligating and ligating an adapter to the 5' end of the target sequence and the 3'extended end of the target isolation probe.
(FR)L'invention concerne des méthodes et des compositions destinées à l'enrichissement en séquences cibles à partir d'une population d'acides nucléiques, consistant à : combiner en solution, une population d'acides nucléiques et une sonde d'isolement cible, la sonde d'isolement cible comprenant un domaine de liaison par affinité; permettre à une région simple brin de la sonde d'isolement cible de s'hybrider à la totalité ou à une partie d'une séquence cible de la population d'acides nucléiques; immobiliser sélectivement les acides nucléiques hybridés à partir de la population contenant les séquences cibles par association de la sonde d'isolement cible avec un domaine de capture et éliminer le matériau non lié; retirer des séquences non cibles à partir de l'extrémité 3' de la séquence cible au moyen d'une ou de plusieurs exonucléases 3', ce qui permet de générer un duplex à extrémité franche ou à extrémité cohésive au niveau de l'extrémité 3' de la séquence cible; éventuellement ligaturer un adaptateur duplex 3' ou une extrémité duplex d'un adaptateur en épingle à cheveux à l'extrémité 3' de la séquence cible et à l'extrémité 5' de la sonde d'isolement cible; étendre l'extrémité 3' de la sonde d'isolement cible pour former une extrémité franche ou une extrémité cohésive au niveau de l'extrémité 5' de la séquence cible appropriée pour une ligature et ligaturer un adaptateur à l'extrémité 5' de la séquence cible et l'extrémité étendue 3' de la sonde d'isolement cible.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)