WIPO logo
Mobile | Deutsch | Español | Français | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Search International and National Patent Collections
World Intellectual Property Organization
Search
 
Browse
 
Translate
 
Options
 
News
 
Login
 
Help
 
Machine translation
1. (WO2016090585) SEQUENCING DATA PROCESSING APPARATUS AND METHOD
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2016/090585    International Application No.:    PCT/CN2014/093516
Publication Date: 16.06.2016 International Filing Date: 10.12.2014
IPC:
G06F 19/22 (2011.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: BGI SHENZHEN [CN/CN]; Main Building, Beishan Industrial Zone, Yantian District Shenzhen, Guangdong 518083 (CN)
Inventors: LIU, Xingmin; (CN).
LIU, Jingyi; (CN).
LIU, Geng; (CN).
ZHAO, Xin; (CN).
YANG, Ming; (CN).
HOU, Yong; (CN).
WU, Kui; (CN).
LI, Bo; (CN)
Agent: TSINGYIHUA INTELLECTUAL PROPERTY LLC; Room 301 Trade Building, Zhaolanyuan, Tsinghua University, Qinghuayuan, Haidian District Beijing 100084 (CN)
Priority Data:
Title (EN) SEQUENCING DATA PROCESSING APPARATUS AND METHOD
(FR) APPAREIL ET PROCÉDÉ DE TRAITEMENT DE DONNÉES DE SÉQUENÇAGE
(ZH) 测序数据处理装置和方法
Abstract: front page image
(EN)Disclosed are a sequencing data processing apparatus, system and method, a computer-readable storage medium, and a method and apparatus for detecting SNP (Single Nucleotide Polymorphism), the sequencing data processing apparatus comprising: a data receiving unit (10) for receiving the sequencing data, wherein the sequencing data comprises a plurality of read pairs with each pair being composed of two reads originating from two locations of one chromosome segment respectively, and each read comprises a gap; a processor (20) for executing a data processing program, wherein executing the data processing program comprises comparing the sequencing data with a reference sequence to obtain a comparison result, and eliminating the gap of each read in the comparison result to obtain a universal comparison result; and at least one storage unit (30) for data storage, wherein the data processing program is comprised.
(FR)L'invention concerne un appareil, un système et un procédé de traitement de données de séquençage, un support d'informations lisible par ordinateur, et un procédé et un appareil permettant de détecter le SNP (polymorphisme mononucléotidique). L'appareil de traitement de données de séquençage comprend : une unité de réception de données (10) pour recevoir les données de séquençage, les données de séquençage comprenant une pluralité de paires de lecture, chaque paire étant composée de deux lectures provenant respectivement de deux emplacements d'un segment chromosomique, et chaque lecture comprenant un espace ; un processeur (20) pour exécuter un programme de traitement de données, l'exécution du programme de traitement de données consistant à comparer les données de séquençage avec une séquence de référence afin d'obtenir un résultat de comparaison, et à éliminer l'espace de chaque lecture dans le résultat de la comparaison pour obtenir un résultat de comparaison universel; et au moins une unité de stockage (30) pour le stockage de données, où est compris le programme de traitement de données.
(ZH)一种测序数据处理装置、系统和方法,一种计算机可读存储介质,一种检测SNP的方法及设备,其中,测序数据处理装置包括:数据接收单元(10),用于接收所述测序数据,所述测序数据包括多对读段对,每对读段对由两个读段组成,分别来自一条染色体片段的两个位置,每个读段都包含缺口;处理器(20),用于执行数据处理程序,执行所述数据处理程序包括实现将所述测序数据与参考序列作比对,获得比对结果,以及消除所述比对结果中的每个读段的缺口,获得通用比对结果;以及,至少一个存储单元(30),用于存储数据,其中包括所述数据处理程序。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Chinese (ZH)
Filing Language: Chinese (ZH)