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1. (WO2016065075) METHOD AND SYSTEM FOR MICROBIOME-DERIVED DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau

Pub. No.: WO/2016/065075 International Application No.: PCT/US2015/056767
Publication Date: 28.04.2016 International Filing Date: 21.10.2015
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
C CHEMISTRY; METALLURGY
12
BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
Q
MEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES OR MICRO-ORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
1
Measuring or testing processes involving enzymes or micro-organisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
68
involving nucleic acids
Applicants:
UBIOME, INC. [US/US]; 360 Langton Street, #301 San Francisco, CA 94103, US
Inventors:
APTE, Zachary; US
RICHMAN, Jessica; US
BEHBAHANI, Siavosh, Rezvan; US
ALMONACID, Daniel; US
Agent:
SCHOX, Jeffrey; US
Priority Data:
62/066,36921.10.2014US
62/087,55104.12.2014US
62/092,99917.12.2014US
62/146,85513.04.2015US
62/147,21214.04.2015US
62/147,36214.04.2015US
62/147,37614.04.2015US
62/206,65418.08.2015US
Title (EN) METHOD AND SYSTEM FOR MICROBIOME-DERIVED DIAGNOSTICS AND THERAPEUTICS
(FR) PROCÉDÉ ET SYSTÈME DE DIAGNOSTIC ET DE THÉRAPIE FONDÉS SUR LE MICROBIOME
Abstract:
(EN) A method for diagnosing and treating an immune microbial dysfunction in a subject, the method comprising: receiving an aggregate set of biological samples from a population of subjects; generating at least one of a microbiome composition dataset and a microbiome functional diversity dataset for the population of subjects; generating a characterization of the immune microbial dysfunction based upon features extracted from at least one of the microbiome composition dataset and the microbiome functional diversity dataset, wherein the characterization is diagnostic of at least one of Crohn's disease, inflammatory bowel disease (IBD), irritable bowel syndrome (IBS), ulcerative colitis, and celiac disease; based upon the characterization, generating a therapy model configured to correct the immune microbial dysfunction; and at an output device associated with the subject, promoting a therapy to the subject based upon the characterization and the therapy model.
(FR) L'invention concerne un procédé de diagnostic et de traitement d'un dysfonctionnement immunitaire d'origine microbienne chez un sujet, le procédé comprenant les étapes consistant : à recevoir un ensemble agrégé d'échantillons biologiques provenant d'une population de sujets ; à générer au moins un ensemble de données concernant la composition du microbiome et/ou un ensemble de données concernant la diversité fonctionnelle du microbiome pour la population de sujets ; à caractériser le dysfonctionnement immunitaire d'origine microbienne sur la base de caractéristiques extraites de l'ensemble de données concernant la composition du microbiome et/ou de l'ensemble de données concernant la diversité fonctionnelle du microbiome, ladite caractérisation correspondant au diagnostic d'au moins l'une des maladies suivantes : maladie de Crohn, maladie inflammatoire chronique de l'intestin (MICI), syndrome du côlon irritable, rectocolite hémorragique et maladie cœliaque ; à générer, sur la base de cette caractérisation, un modèle thérapeutique conçu pour corriger le dysfonctionnement immunitaire d'origine microbienne ; et à promouvoir auprès du sujet, au niveau d'un dispositif de sortie qui lui est associé, un traitement sur la base de la caractérisation et du modèle thérapeutique.
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Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)