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1. (WO2016060974) METHODS, SYSTEMS, AND COMPUTER-READABLE MEDIA FOR ACCELERATED BASE CALLING
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2016/060974    International Application No.:    PCT/US2015/055070
Publication Date: 21.04.2016 International Filing Date: 12.10.2015
IPC:
G06F 19/20 (2011.01)
Applicants: LIFE TECHNOLOGIES CORPORATION [US/US]; c/o Legal Department, IP Docketing 5823 Newton Drive Carlsbad, California 92008 (US)
Inventors: DONNET, Benjamin; (AU)
Agent: D'AVIGNON-AUBUT, Christian; (US)
Priority Data:
62/063,124 13.10.2014 US
Title (EN) METHODS, SYSTEMS, AND COMPUTER-READABLE MEDIA FOR ACCELERATED BASE CALLING
(FR) PROCÉDÉS, SYSTÈMES, ET SUPPORTS LISIBLES PAR ORDINATEUR POUR APPEL DE BASES ACCÉLÉRÉ
Abstract: front page image
(EN)Embodiments disclose methods, systems, and computer-readable media for accelerated base calling of sequencing data. These methods may be adapted to accelerate sequence determination for data arising from a variety of different nucleic acid sequencing platforms. In various embodiments, configurable logic circuits such as FPGAs and GPUs may be adapted to perform raw signal processing, basecalling, and/or sequence determination operations providing further enhancements to the sequence analysis methods.
(FR)Des modes de réalisation concernent des procédés, des systèmes, et des supports lisibles par ordinateur pour des appels de bases accélérés de données de séquençage. Ces procédés peuvent être adaptés afin d'accélérer la détermination de séquence de données provenant d'une variété de différentes plateformes de séquençage d'acide nucléique. Dans divers modes de réalisation, des circuits logiques configurables, FPGA et GPU par exemple, peuvent être adaptés pour exécuter un traitement de signal brut, un appel de bases et/ou des opérations de détermination de séquence fournissant d'autres améliorations aux procédés d'analyse de séquence.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
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African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)