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1. (WO2016054135) NEXT-GENERATION SEQUENCING FOR PHASED HLA CLASS I ANTIGEN RECOGNITION DOMAIN EXONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2016/054135    International Application No.:    PCT/US2015/053087
Publication Date: 07.04.2016 International Filing Date: 30.09.2015
IPC:
C40B 20/00 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01)
Applicants: GEORGETOWN UNIVERSITY [US/US]; 37th and O Streets, NW Washington, DC 20057-1408 (US)
Inventors: HURLEY, Carolyn, K.; (US).
NG-MCCLELLAND, Jennifer; (US).
HOU, Lihua; (US)
Agent: STEELE, Alan, W.; (US)
Priority Data:
62/058,246 01.10.2014 US
Title (EN) NEXT-GENERATION SEQUENCING FOR PHASED HLA CLASS I ANTIGEN RECOGNITION DOMAIN EXONS
(FR) SÉQUENÇAGE DE NOUVELLE GÉNÉRATION POUR EXONS DE DOMAINE DE RECONNAISSANCE D'ANTIGÈNE HLA DE CLASSE I À PHASE
Abstract: front page image
(EN)Provided are methods for the rapid and accurate determination of the phase of nucleotide polymorphisms in the functionally important region of an HLA protein, i.e., which polymorphic nucleotides are encoded by the same allele. This allows the resolution of an HLA assignment to a specific genotype, and thereby more accurate matching for transplantation and more accurate testing of HLA in general for other applications. In accordance with the instant invention, the phase of polymorphic nucleotides in the functionally relevant region of the HLA molecule, the antigen recognition domain exons, is determined in a single next-generation sequence run.
(FR)L'invention concerne des procédés pour la détermination rapide et précise de la phase de polymorphismes nucléotidiques dans la région fonctionnellement importante d'une protéine HLA, c'est-à-dire, de détermination des nucléotides polymorphes codés par le même allèle. Ils permettent la résolution d'une attribution de HLA à un génotype spécifique, et ainsi une adéquation plus précise pour une transplantation et un test plus précis de HLA en général pour d'autres applications. Conformément à la présente invention, la phase des nucléotides polymorphes dans la région fonctionnellement pertinente de la molécule HLA, les exons de domaine de reconnaissance de l'antigène, est déterminée en un seul cycle de séquençage de nouvelle génération.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)