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1. (WO2015126823) A METHOD FOR SINGLE CELL SEQUENCING OF MIRNAS AND OTHER CELLULAR RNAS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2015/126823    International Application No.:    PCT/US2015/016153
Publication Date: 27.08.2015 International Filing Date: 17.02.2015
IPC:
C12N 15/09 (2006.01)
Applicants: BOARD OF REGENTS, THE UNIVERSITY OF TEXAS SYSTEM [US/US]; 201 W. 7th Street Austin, TX 78701 (US)
Inventors: COREY, David; (US).
CHU, Yongjun; (US).
JANOWSKI, Bethany; (US)
Agent: HIGHLANDER, Steven, L.; (US)
Priority Data:
61/941,177 18.02.2014 US
Title (EN) A METHOD FOR SINGLE CELL SEQUENCING OF MIRNAS AND OTHER CELLULAR RNAS
(FR) PROCEDES POUR LE SEQUENCAGE DE CELLULES UNIQUES DE MICRO-ARN ET D'AUTRES ARN CELLULAIRES
Abstract: front page image
(EN)Provided herein are methods for single cell sequencing of miRNAs and other low abundance and/or or short cellular RNAs. A method is provided for preparing an RNA sample for sequencing comprising: (a) obtaining a sample comprising RNA molecules; (b) self-ligating each RNA molecule in the sample to form circular RNA; (c) hybridizing a first set of random primers to the circular RNA; (d) extending the first set of random primers; (e) self-ligating the cDNA to form a circular cDNA; (f) hybridizing a second set of random primers to the circular cDNA; and (g) extending the second set of random primers hybridized to the circular cDNA to form double-stranded cDNA. In some aspects, steps (c) and (d) and/or steps (f) and (g) may be performed simultaneously. In other aspects, steps (c) and (d) and/or steps (f) and (g) may be performed sequentially in the absence of exogenous manipulation.
(FR)La présente invention concerne des procédés pour le séquençage de cellules uniques de micro-ARN et d'autres d'ARN cellulaires courts et/ou peu abondants. L'invention concerne un procédé de préparation d'un échantillon d'ARN en vue du séquençage, ledit procédé consistant à : (a) prélever un échantillon comprenant des molécules d'ARN ; (b) auto-ligaturer chaque molécule d'ARN de l'échantillon pour former un ARN circulaire ; (c) hybrider un premier ensemble d'amorces aléatoires à l'ARN circulaire; (d) allonger le premier ensemble d'amorces aléatoires ; (e) auto-ligaturer l'ADNc pour former un ADNc circulaire ; (f) hybrider un second ensemble d'amorces aléatoires à l'ADNc circulaire ; et (g) allonger le second ensemble d'amorces aléatoires hybridé à l'ADNc circulaire pour former de l'ADNc double brin. Dans certains aspects, les étapes c) et d) et/ou les étapes (f) et (g) peuvent être mises en oeuvre simultanément. Dans d'autres aspects, les étapes c) et d) et/ou les étapes (f) et (g) peut être mises en oeuvre séquentiellement, en l'absence de manipulation exogène.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)