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1. (WO2015038972) QUANTUM MOLECULAR SEQUENCING (QM-SEQ): IDENTIFICATION OF UNIQUE NANOELECTRONIC TUNNELING SPECTROSCOPY FINGERPRINTS FOR DNA, RNA, AND SINGLE NUCLEOTIDE MODIFICATIONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2015/038972    International Application No.:    PCT/US2014/055512
Publication Date: 19.03.2015 International Filing Date: 12.09.2014
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF COLORADO, A BODY CORPORATE [US/US]; 1800 Grant Street, 8th Floor Denver, Colorado 80203 (US)
Inventors: NAGPAL, Prashant; (US).
CHATTERJEE, Anushree; (US).
RIBOT, Josep Casamada; (US)
Agent: SCARR, Rebecca B; (US)
Priority Data:
61/877,634 13.09.2013 US
Title (EN) QUANTUM MOLECULAR SEQUENCING (QM-SEQ): IDENTIFICATION OF UNIQUE NANOELECTRONIC TUNNELING SPECTROSCOPY FINGERPRINTS FOR DNA, RNA, AND SINGLE NUCLEOTIDE MODIFICATIONS
(FR) SÉQUENÇAGE MOLÉCULAIRE QUANTIQUE (QM-SEQ) : IDENTIFICATION D'EMPREINTES UNIQUES OBTENUES PAR SPECTROSCOPIE NANOÉLECTRONIQUE À EFFET TUNNEL DE MODIFICATIONS TOUCHANT L'ADN, L'ARN ET LES NUCLÉOTIDES UNIQUES
Abstract: front page image
(EN)Techniques, methods, devices, and compositions are disclosed that are useful in identifying and sequencing natural and synthetic, and modified and unmodified DNA, RNA, PNA, DNA/RNA nucleotides. The disclosed techniques, methods, devices, and compositions are useful in identifying various modifications, DNA/RNA damage, and nucleotide structure, using nanoelectronic quantum tunneling spectroscopy, which may be referred to as QM-Seq. The methods and compositions can include the use of a charged, smooth substrate for deposition of single stranded nucleotides and polynucleotide macromolecules, scanning the modified or unmodified DNA/RNA/PNA, comparing the electronic signatures of an unknown nucleobase against a database of electronic fingerprints of known nucleobases, including natural and synthetic, modified and unmodified nucleobases, and secondary/tertiary structure, obtained under the same or similar conditions, for example where the nucleobase is in an acidic environment.
(FR)La présente invention concerne des techniques, des procédés, des dispositifs et des compositions pouvant être utilisés pour identifier et séquencer des ADN, ARN, APN et nucléotides ADN/ARN naturels et synthétiques, modifiés et non modifiés. Les techniques, procédés, dispositifs et compositions selon l'invention peuvent être utilisés pour identifier diverses modifications, lésions de l'ADN/ARN et structures nucléotidiques, par spectroscopie nanoélectronique quantique à effet tunnel, autrement connue sous le nom de QM-Seq. Lesdits procédés et compositions peuvent impliquer les étapes consistant à utiliser un substrat lisse chargé en vue du dépôt de macromolécules à base de nucléotides et de polynucléotides simple brin, à balayer l'ADN/ARN/APN modifié ou non modifié, à comparer les signatures électroniques d'une nucléobase inconnue avec une base de données d'empreintes électroniques de nucléobases connues, naturelles et de synthèse, modifiées et non modifiées, et une structure secondaire/tertiaire, obtenue dans des conditions identiques ou similaires, par exemple quand la nucléobase se trouve dans un environnement acide.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, ST, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)