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1. (WO2014206568) DIRECT, PROGRAMMABLE DETECTION OF EPIGENETIC DNA CYTOSINE MODIFICATIONS USING TAL EFFECTORS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2014/206568    International Application No.:    PCT/EP2014/001753
Publication Date: 31.12.2014 International Filing Date: 26.06.2014
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: UNIVERSITÄT KONSTANZ [DE/DE]; Universitätsstraße 10 78464 Konstanz (DE)
Inventors: SUMMERER, Daniel; (DE).
KUBIK, M. Grzegorz; (DE).
SCHMIDT, Moritz Johannes; (DE)
Agent: LENHARD, Konstanze; Müller-Boré & Partner Patentanwälte PartG mbB Friedenheimer Brücke 21 80639 München (DE)
Priority Data:
13003252.7 26.06.2013 EP
Title (EN) DIRECT, PROGRAMMABLE DETECTION OF EPIGENETIC DNA CYTOSINE MODIFICATIONS USING TAL EFFECTORS
(FR) DÉTECTION DIRECTE, PROGRAMMABLE, DE MODIFICATIONS ÉPIGÉNÉTIQUES DE CYTOSINES DE L'ADN À L'AIDE D'EFFECTEURS TAL
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to methods for the differentiation of a 5-hydroxymethyl modification of a cytosine residue of interest in a nucleic acid molecule from (i) a 5-methyl modification of said cytosine residue of interest o,r (ii) said unmodified cytosine residue of interest, said methods making use of the capability of transcription-activator-like effector (TALE) proteins to preferentially bind with strong affinity to nucleic acid sequences containing non-modified cytosine residues or 5-methyl modified cytosine residues, and to bind, if at all, with only strongly reduced affinity to nucleic acid sequences containing 5-hydroxymethyl modified cytosine residues. The present invention further relates to respective uses of TALE proteins for the differentiation of a 5-hydroxymethyl modification of a cytosine residue of interest in a nucleic acid molecule from (i) a 5-methyl modification of said cytosine residue of interest or (ii) said unmodified cytosine residue of interest.
(FR)La présente invention concerne des procédés de différenciation d'une modification 5-hydroxyméthyle d'un résidu cytosine d'intérêt dans une molécule d'acide nucléique à partir (i) d'une modification 5-méthyle dudit résidu cytosine d'intérêt ou (ii) dudit résidu cytosine non modifié d'intérêt, lesdits procédés utilisant la capacité de protéines effectrices de type activateur de la transcription (TALE) à se lier préférentiellement avec une forte affinité à des séquences d'acide nucléique contenant des résidus cytosine non modifiés ou des résidus cytosine modifiés par 5-méthyle, et à se lier, si tel est le cas, uniquement avec une affinité fortement réduite à des séquences d'acide nucléique contenant des résidus cytosine 5-hydroxyméthyle modifiés. La présente invention concerne en outre des utilisations respectives de protéines TALE pour la différenciation d'une modification 5-hydroxyméthyle d'un résidu cytosine d'intérêt dans une molécule d'acide nucléique à partir (i) d'une modification 5-méthyle dudit résidu cytosine d'intérêt ou (ii) dudit résidu cytosine non modifié d'intérêt.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)