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1. (WO2014189957) TRANSPOSITION INTO NATIVE CHROMATIN FOR PERSONAL EPIGENOMICS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2014/189957    International Application No.:    PCT/US2014/038825
Publication Date: 27.11.2014 International Filing Date: 20.05.2014
IPC:
C12P 19/34 (2006.01)
Applicants: THE BOARD OF TRUSTEES OF THE LELAND STANFORD JUNIOR UNIVERSITY [US/US]; Office of the General Counsel Building 170, 3rd Floor, Main Quad P.O. Box 20386 Stanford, CA 94305-2038 (US)
Inventors: GIRESI, Paul; (US).
BUENROSTRO, Jason D.; (US).
CHANG, Howard Y.; (US).
GREENLEAF, William J.; (US)
Agent: KEDDIE, James S.; (US)
Priority Data:
61/826,728 23.05.2013 US
Title (EN) TRANSPOSITION INTO NATIVE CHROMATIN FOR PERSONAL EPIGENOMICS
(FR) TRANSPOSITION EN UNE CHROMATINE ENDOGÈNE PERMETTANT L'ÉPIGÉNOMIQUE PERSONNELLE
Abstract: front page image
(EN)Provided herein is a method for analyzing polynucleotides such as genomic DNA. In certain embodiments, the method comprises: (a) treating chromatin isolated from a population of cells with an insertional enzyme complex to produce tagged fragments of genomic DNA; (b) sequencing a portion of the tagged fragments to produce a plurality of sequence reads; and (c) making an epigenetic map of a region of the genome of the cells by mapping information obtained from the sequence reads to the region. A kit for performing the method is also provided.
(FR)La présente invention concerne un procédé d'analyse de polynucléotides tels que de l'ADN génomique. Dans certains mode de réalisation, le procédé comprend : (a) le traitement de la chromatine isolée à partir d'une population de cellules avec un complexe enzymatique à insertion pour produire des fragments à étiquette de l'ADN génomique; (b) le séquençage d'une partie des fragments à étiquette pour produire une pluralité de lectures de séquence; et (c) la réalisation d'une carte épigénétique d'une région du génome des cellules par cartographie des informations obtenues à partir des lectures de séquence de la région. L'invention concerne également une trousse pour la mise en œuvre du procédé.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)