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1. (WO2014189085) DEVICE AND METHOD FOR PRETREATING SEQUENCER
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2014/189085    International Application No.:    PCT/JP2014/063498
Publication Date: 27.11.2014 International Filing Date: 21.05.2014
Chapter 2 Demand Filed:    18.03.2015    
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12M 1/00 (2006.01)
Applicants: UNIVERSAL BIO RESEARCH CO.,LTD. [JP/JP]; 88, Kamihongou, Matsudo-shi, Chiba 2710064 (JP)
Inventors: TAJIMA Hideji; (JP)
Agent: DOBASHI Akira; Urban Toranomon Building, 16-4, Toranomon 1-chome, Minato-ku, Tokyo 1050001 (JP)
Priority Data:
2013-107514 21.05.2013 JP
Title (EN) DEVICE AND METHOD FOR PRETREATING SEQUENCER
(FR) DISPOSITIF ET PROCÉDÉ DE PRÉTRAITEMENT DE SÉQUENCEUR
(JA) シーケンサ前処理装置およびその方法
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to a device and a method for pretreating a sequencer, and addresses the problem of providing a highly reliable pretreatment for analyzing a large-scale nucleotide sequence. A method for pretreating a sequencer comprises: an extraction step of mixing a sample, an extraction reagent solution and a magnetic particle suspension together using a sequencer pretreatment device to extract a nucleic acid, wherein the sequencer pretreatment device is equipped with a suction/ejection mechanism, a nozzle head equipped with a nozzle onto which a dispenser chip is to be mounted in a detachable manner, containers in which various solutions including the magnetic particle suspension are respectively placed, a movement mechanism which can cause the relative movement of the nozzle between the containers, and a magnetic force section which can apply a magnetic field to the inside of the mounted dispenser chip, and wherein the sample, the extraction reagent solution and the magnetic particle suspension are respectively placed in the containers; a fragmentation production step of mixing the nucleic acid with a fragmentation solution placed in some of the containers using the sequencer pretreatment device to fragment the nucleic acid and then producing a fragment having a nucleotide sequence length suitable for the sequencer from the fragmented nucleic acid products using the magnetic particle suspension; and an amplification pretreatment step of dispensing a predetermined volume of a solution containing the produced fragment into each of the reaction containers using the sequencer pretreatment device.
(FR)La présente invention concerne un dispositif et un procédé de prétraitement d'un séquenceur et aborde le problème de pourvoir un prétraitement très fiable destiné à analyser une séquence de nucléotides à grande échelle. Un procédé de prétraitement d'un séquenceur comprend : une étape d'extraction destinée à mélanger un échantillon, une solution réactive d'extraction et une suspension de particules magnétiques utilisant conjointement un dispositif de prétraitement de séquenceur pour extraire un acide nucléique, le dispositif de prétraitement de séquenceur étant équipé d'un mécanisme d'éjection/d'aspiration, une tête d'ajutage équipée d'un ajutage dans lequel une puce de distribution devant être montée amovible, des récipients dans lesquels diverses solutions comprenant la suspension de particules magnétiques sont placées respectivement, un mécanisme de déplacement qui peut amener l'ajutage à se déplacer de façon réciproque entre les récipients et une section à force magnétique qui peut appliquer un champ magnétique à l'intérieur de la puce de distribution montée, et l'échantillon, la solution réactive d'extraction et la suspension de particules magnétiques étant placés respectivement dans les récipients ; une étape de production par fragmentation consistant à mélanger l'acide nucléique à une solution de fragmentation placée dans certains récipients à l'aide du dispositif de prétraitement de séquenceur pour fragmenter l'acide nucléique et ensuite produire un fragment ayant une longueur de séquence nucléotide adaptée au séquenceur à partir des produits d'acide nucléique fragmentés à l'aide de la suspension de particules magnétiques ; et une étape de prétraitement d'amplification destinée à distribuer un volume prédéfini d'une solution contenant le fragment produit dans chacun des récipients de réaction à l'aide du dispositif de prétraitement de séquenceur.
(JA) シーケンサ前処理装置及び方法に関し、大規模な塩基配列を解析するための信頼性の高い前処理を提供することを目的とする。 吸引吐出機構、分注チップが着脱可能に装着されるノズルを有するノズルヘッド、磁性粒子懸濁液を含む各種液を収容する容器群、ノズルを容器群との間で相対的に移動可能とする移動機構、及び装着された分注チップ内に磁場を及ぼすことが可能な磁力部を有するシーケンサ前処理装置を用いて、容器群に収容された検体、抽出用試薬溶液および磁性粒子懸濁液を混合して、核酸を抽出する抽出工程と、シーケンサ前処理装置を用いて、核酸を容器群に収容された断片化溶液と混合して断片化し、断片化された核酸から磁性粒子懸濁液を用いてシーケンサに応じた塩基配列数の断片を作成する断片化作成工程と、シーケンサ前処理装置を用いて、作成した断片を含有する溶液の所定量を前記反応容器内に分注する増幅前処理工程と、を有するように構成する。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)