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1. (WO2014181854) HLA GENE MULTIPLEX DNA TYPING METHOD AND KIT
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2014/181854    International Application No.:    PCT/JP2014/062433
Publication Date: 13.11.2014 International Filing Date: 09.05.2014
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12N 15/09 (2006.01)
Applicants: GENODIVE PHARMA INC. [JP/JP]; 1-19-35 Ryokuen, Izumi-ku, Yokohama-shi, Kanagawa 2450002 (JP)
Inventors: SHIINA, Takashi; (JP).
SUZUKI, Shingo; (JP).
WADA, Yuki; (JP).
MITSUNAGA, Shigeki; (JP).
INOKO, Hidetoshi; (JP)
Agent: UCHIDA, Naoto; (JP)
Priority Data:
2013-099547 09.05.2013 JP
Title (EN) HLA GENE MULTIPLEX DNA TYPING METHOD AND KIT
(FR) MÉTHODE ET KIT DE TYPAGE MULTIPLEX DE L'ADN DU GÈNE HLA
(JA) HLA遺伝子のマルチプレックスDNAタイピング方法及びキット
Abstract: front page image
(EN)The purpose is to provide a high-precision DNA typing method and kit that make full use of a high-throughput sequencer and eliminate the ambiguity derived from phase ambiguity. The invention provides an HLA DNA typing method characterized by including: (1) a step for providing a set of primers that each hybridize specifically to an upstream region and a downstream region of at least two genes selected from genes belonging to HLA class I and class II in the nucleotide sequence of the human genome and amplify under identical PCR conditions; (2) a step for amplifying these at least two genes in a test sample (DNA) simultaneously in the same container under identical PCR conditions using this set of primers; (3) a step for determining the nucleotide sequence of the PCR product; and (4) an optional step for conducting a homology search of a database.
(FR)L'objet de la présente invention est de pourvoir à une méthode et à un kit de typage haute précision de l'ADN qui utilisent pleinement un séquenceur à haut débit et éliminent l’ambiguïté dérivée d'une ambiguïté de phase. L'invention concerne une méthode de typage de l'ADN du gène HLA caractérisée en ce qu'elle comprend : (1) une étape consistant à fournir un ensemble d'amorces, chacune de celles-ci s'hybridant spécifiquement à une région en amont et à une région en aval d'au moins deux gènes choisis parmi les gènes appartenant au gène HLA de classe I et de classe II dans la séquence nucléotidique du génome humain et à les amplifier dans des conditions identiques de PCR ; (2) une étape consistant à amplifier lesdits deux gènes ou plus dans un échantillon d'analyse (ADN) simultanément dans le même récipient dans des conditions identiques de PCR à l'aide dudit ensemble d'amorces ; (3) une étape consistant à déterminer la séquence nucléotidique du produit de la PCR ; et (4) une étape facultative consistant à mettre en œuvre une recherche d'homologies dans une base de données.
(JA) ハイスループットシークエンサーを駆使し、フェーズ・アンビギュイティに由来する曖昧さを排除した高精度のDNAタイピング方法及びキットを提供することを目的とする。本発明は、(1)ヒトゲノム塩基配列におけるHLAクラスI及びクラスIIに属する遺伝子から選択される少なくとも2種の遺伝子の上流領域及び下流領域に各々特異的にハイブリダイズし、かつ同一のPCR条件にて増幅するプライマーセットを準備するステップ;(2)前記プライマーセットを用いて、被検試料(DNA)中の前記少なくとも2種の遺伝子を同一のPCR条件で同時に同一容器内で増幅するステップ;(3)PCR産物の塩基配列を決定するステップ;及び(4)任意に、データベースとのホモロジー検索を実施するステップを含むことを特徴とする、HLAのDNAタイピング方法を提供する。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
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African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)