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1. (WO2014176687) YIN-YANG GENE EXPRESSION RATIO MODELS FOR GENERATION OF CLINICAL PROGNOSIS SIGNATURES FOR LUNG CANCER PATIENTS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2014/176687    International Application No.:    PCT/CA2014/050400
Publication Date: 06.11.2014 International Filing Date: 28.04.2014
IPC:
C40B 40/06 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01), C40B 30/04 (2006.01), G01N 33/48 (2006.01), G06F 19/20 (2011.01), C40B 30/02 (2006.01)
Applicants: UNIVERSITY OF MANITOBA [CA/CA]; 631 Drake Centre, 181 Freedman Crescent Winnipeg, Manitoba R3T 5V4 (CA)
Inventors: XU, Wayne; (CA)
Agent: POLONENKO, Daniel; Gowling Lafleur Henderson LLP Box 30, 2300 - 550 Burrard Street Vancouver, British Columbia V6C 2B5 (CA)
Priority Data:
61/817,116 29.04.2013 US
Title (EN) YIN-YANG GENE EXPRESSION RATIO MODELS FOR GENERATION OF CLINICAL PROGNOSIS SIGNATURES FOR LUNG CANCER PATIENTS
(FR) MODÈLES DE RAPPORT D'EXPRESSION GÉNIQUE DE TYPE YIN-YANG POUR LA GÉNÉRATION DE SIGNATURES PRONOSTIQUES CLINIQUES POUR DES PATIENTS ATTEINTS D'UN CANCER DU POUMON
Abstract: front page image
(EN)A method for selection of a set of Yin genes and Yang genes for use in development of cancer patient prognosis, comprising: (i) screening gene expression data sets collected from a plurality of cancer tissue samples of patients to identify a first plurality of genes expressed in cancerous cells; (ii) screening gene expression data sets collected from a plurality of healthy subjects or cancer adjacent normal tissue samples to identify a second plurality of genes expressed in healthy cells; and (iii) selecting a set of Yin genes and a set of selected Yang genes using pathway and gene functional analysis; (iv) building a Yin and Yang gene expression ratio (YMR) model as a cancer prognosis signature. Implementing prognosis signature software for a cancer patient by: (v) detecting the expression values of selected Yin genes and selected Yang genes; and (vi) calculating the YMR for predicting the patient's clinical outcomes.
(FR)La présente invention concerne une méthode de sélection d'un jeu de gènes Yin et de gènes Yang destinés à être utilisés dans le développement d'un pronostic de patient cancéreux, comprenant : (i) le criblage de jeux de données d'expression génique collectées à partir d'une pluralité d'échantillons de tissus cancéreux de patients pour identifier une première pluralité de gènes exprimés dans des cellules cancéreuses; (ii) le criblage de jeux de données d'expression génique collectées à partir d'une pluralité de sujets sains ou d'échantillons de tissus normaux adjacents à un cancer pour identifier une seconde pluralité de gènes exprimés dans des cellules saines; et (iii) la sélection d'un jeu de gènes Yin et d'un jeu de gènes Yang sélectionnés à l'aide d'une analyse fonctionnelle des voies et gènes; (iv) la construction d'un modèle de rapport d'expression génique de type Yin et Yang (YMR) comme signature pronostique d'un cancer. Mise en œuvre d'un logiciel de signature pronostique pour un patient cancéreux par : (v) détection des valeurs d'expression de gènes Yin sélectionnés et de gènes Yang sélectionnés; et (vi) calcul du YMR pour la prédiction du résultat clinique du patient.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IR, IS, JP, KE, KG, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SA, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
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European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, KM, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)