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1. (WO2013112745) PEPTIDE IDENTIFICATION AND SEQUENCING BY SINGLE-MOLECULE DETECTION OF PEPTIDES UNDERGOING DEGRADATION
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2013/112745    International Application No.:    PCT/US2013/023002
Publication Date: 01.08.2013 International Filing Date: 24.01.2013
IPC:
G01N 33/52 (2006.01)
Applicants: THE REGENTS OF THE UNIVERSITY OF COLORADO, A BODY CORPORATE [US/US]; 1800 Grant Street 8th Floor Denver, Colorado 80203 (US)
Inventors: HESSELBERTH, Jay R.; (US)
Agent: SWANSON & BRATSCHUN, L.L.C.; 8210 SouthPark Terrace Littleton, Colorado 80120 (US)
Priority Data:
61/589,985 24.01.2012 US
Title (EN) PEPTIDE IDENTIFICATION AND SEQUENCING BY SINGLE-MOLECULE DETECTION OF PEPTIDES UNDERGOING DEGRADATION
(FR) IDENTIFICATION ET SÉQUENÇAGE DE PEPTIDES PAR LA DÉTECTION D'UNE SEULE MOLÉCULE DE PEPTIDES SUBISSANT UNE DÉGRADATION
Abstract: front page image
(EN)The present disclosure provides peptide amino acid sequencing and identification methods and kits for performing such methods. For example, single-molecule detection of fluorophore-labeled peptides is disclosed using multiple rounds of standard Edman degradation or using digestion by chemicals or enzymes. Different fluorophores covalently attached to each of a specific type of amino acid side chain of a peptide provide for the derivation of the peptide's encoded amino acid sequence following image alignments of multiple Edman cycles or following digestion by chemicals or enzymes. The amino acid sequence of a peptide and/or the identity of the peptide can be determined by bioinformatic analysis based on the encoded amino acid sequence. The present disclosure further provides peptide derivatization and immobilization strategies to enable the sequencing and identification of a single peptide or a plurality of peptides.
(FR)La présente invention concerne des méthodes de séquençage et d'identification d'acides aminés de peptides et des kits permettant de réaliser de telles méthodes. Par exemple, la détection d'une seule molécule de peptides marqués au fluorophore est décrite à l'aide de multiples séries de dégradation d'Edman standard ou à l'aide d'une digestion par des produits chimiques ou des enzymes. Différents fluorophores attachés de manière covalente à chaque type spécifique de chaîne latérale d'acides aminés d'un peptide permettent la dérivation d'une séquence d'acides aminés codée du peptide suite à des alignements d'image de multiples cycles d'Edman ou suite à une digestion par des produits chimiques ou des enzymes. La séquence d'acides aminés d'un peptide et/ou l'identité du peptide peut être déterminée par une analyse bioinformatique basée sur la séquence d'acides aminés codée. La présente invention concerne en outre la dérivation de peptides et des stratégies d'immobilisation pour permettre le séquençage et l'identification d'un peptide unique ou d'une pluralité de peptides.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)