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Pub. No.:    WO/2013/058280    International Application No.:    PCT/JP2012/076841
Publication Date: 25.04.2013 International Filing Date: 17.10.2012
C12M 1/34 (2006.01), C12Q 1/04 (2006.01), G01N 27/62 (2006.01), G01N 33/48 (2006.01)
Applicants: SHIMADZU CORPORATION [JP/JP]; 1, Nishinokyo-Kuwabara-cho, Nakagyo-ku, Kyoto-shi, Kyoto 6048511 (JP)
Inventors: OJIMA, Noriyuki; (JP).
OGATA, Koretsugu; (JP).
SHIMA, Keisuke; (JP).
TAMURA, Hiroto; (JP).
HOSODA, Akifumi; (JP).
HOTTA, Yudai; (JP)
Agent: KYOTO INTERNATIONAL PATENT LAW OFFICE; Hougen-Sizyokarasuma Building, 37, Motoakuozi-tyo, Higasinotouin Sizyo-sagaru, Simogyo-ku, Kyoto-si, Kyoto 6008091 (JP)
Priority Data:
2011-229226 18.10.2011 JP
(JA) 細胞識別装置及びプログラム
Abstract: front page image
(EN)Provided is a device for identifying the type of a test cell on the basis of results obtained by mass spectrometry of the test cell, wherein provided are an upper DB (21) in which is recorded a mass list listing the ion mass of the constituent components of known cells and a lower DB (22) in which is recorded a partial mass list listing only those ion masses that are specific to each strain, the device being configured such that at first the upper DB (21) is searched by using a test mass list created from the mass spectrometry results of the test cell and organism species to be targeted in subsequent searching are determined on the basis of the search, and thereafter masses common to the organism species are deleted from the mass list of the test cell, and the lower DB (22) is searched by using the post-deletion mass list. This configuration makes it possible to extract at high accuracy a cell closer to the test cell from among a plurality of genetically related known cells.
(FR)La présente invention concerne un dispositif d'identification du type auquel appartient une cellule d'essai sur la base de résultats obtenus par spectrométrie de masse concernant ladite cellule d'essai. Ledit dispositif comprend une base de données (BD) supérieure (21) dans laquelle est enregistrée une liste des masses indiquant la masse des ions des composants constitutifs de cellules connues et une BD inférieure (22) dans laquelle est enregistrée une liste partielle des masses n'indiquant que les masses des ions spécifiques de chaque souche, ledit dispositif étant configuré de façon à ce que ce soit d'abord la BD supérieure qui soit examinée au moyen d'une liste de masses d'essai générée à partir des résultats de la spectrométrie de masse pratiquée sur la cellule d'essai, puis à ce que les espèces d'organismes devant être ciblés lors de recherches ultérieures soient déterminées sur la base de cet examen, suite à quoi les masses communes aux espèces d'organismes sont supprimées de la liste des masses de la cellule d'essai et la BD inférieure (22) est examinée au moyen de la liste des masses après suppression. Cette configuration permet d'extraire avec une grande précision une cellule très proche de la cellule d'essai parmi une pluralité de cellules génétiquement liées connues.
(JA) 被検細胞を質量分析して得られた結果に基づいて該被検細胞の種類を識別する装置において、既知細胞の構成成分のイオン質量が記載された質量リストを収録した上位DB21と、前記イオン質量のうち各株に特異的なものだけを記載した部分質量リストを収録した下位DB22とを設け、まず、被検細胞の質量分析結果から作成された被検質量リストを用いて上位DB21を検索し、その検索に基づいて以降の検索で対象とする生物種を決定した後、前記被検細胞の質量リストから前記生物種に共通する質量を削除し、削除後の質量リストを用いて下位DB22に対する検索を行う構成とする。これにより、遺伝的に近縁な複数の既知細胞の中から被検細胞により近いものを高い精度で抽出することが可能となる。
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
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European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: Japanese (JA)
Filing Language: Japanese (JA)