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1. (WO2013049312) SEGMENTING BIOLOGICAL STRUCTURES FROM MICROSCOPY IMAGES
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2013/049312    International Application No.:    PCT/US2012/057504
Publication Date: 04.04.2013 International Filing Date: 27.09.2012
IPC:
G06T 7/00 (2006.01), G06F 19/00 (2011.01)
Applicants: CARNEGIE MELLON UNIVERSITY [US/US]; 5000 Forbes Avenue Pittsburgh, Pennsylvania 15213 (US)
Inventors: CHEN, Cheng; (US).
ROHDE, Gustavo Kunde; (US).
OZOLEK, John A.; (US).
WANG, Wei; (US)
Agent: MCDONOUGH, Christina V.; Fish & Richardson P.C. P.O. Box 1022 Minneapolis, MN 55440-1022 (US)
Priority Data:
61/626,598 29.09.2011 US
Title (EN) SEGMENTING BIOLOGICAL STRUCTURES FROM MICROSCOPY IMAGES
(FR) SEGMENTATION DE STRUCTURES BIOLOGIQUES À PARTIR D'IMAGES DE MICROSCOPIE
Abstract: front page image
(EN)A method performed by one or more processors, includes: receiving an image to be segmented into one or more representations of one or more biological structures; accessing data representing a set of biological structures that are derived from other biological structures delineated in a training image, wherein the training image is associated with a level of modality that corresponds to a level of modality associated with the image to be segmented; computing a normalized cross correlation of the received image against one or more of the biological structures in the set of biological structures; generating, based on computing, seed data representing an estimate of a spatial organization of the one or more biological structures in the received image; and segmenting, based on a normalized cross correction of the received image to the seed data, the received image into the one or more representations of the one or more biological structures.
(FR)Selon la présente invention, un procédé réalisé par un ou plusieurs processeurs comprend les étapes consistant à : recevoir une image à segmenter en une ou plusieurs représentations d'une ou plusieurs structures biologiques ; accéder à des données représentant un ensemble de structures biologiques qui sont déduites à partir d'autres structures biologiques délimitées dans une image d'apprentissage, l'image d'apprentissage étant associée à un niveau de modalité qui correspond à un niveau de modalité associé à l'image à segmenter ; calculer une corrélation croisée normalisée de l'image reçue vis-à-vis d'une ou plusieurs structures biologiques dans l'ensemble de structures biologiques ; générer, sur la base d'un calcul, des données de germe représentant une estimation d'une organisation spatiale de la ou des structures biologiques dans l'image reçue ; et segmenter, sur la base d'une correction croisée normalisée de l'image reçue aux données de germe, de l'image reçue en la ou les représentations de la ou des structures biologiques.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BN, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PA, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)