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1. (WO2012104764) METHOD FOR ESTIMATION OF INFORMATION FLOW IN BIOLOGICAL NETWORKS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2012/104764    International Application No.:    PCT/IB2012/050405
Publication Date: 09.08.2012 International Filing Date: 30.01.2012
IPC:
G06F 19/12 (2011.01), G06F 19/20 (2011.01), G06F 19/24 (2011.01)
Applicants: KONINKLIJKE PHILIPS N.V. [NL/NL]; High Tech Campus 5 NL-5656 AE Eindhoven (NL) (For All Designated States Except US).
VARADAN, Vinay [IN/US]; (NL) (For US Only).
MITTAL, Prateek [IN/US]; (NL) (For US Only).
KAMALAKARAN, Sitharthan [IN/US]; (NL) (For US Only).
DIMITROVA, Nevenka [US/US]; (NL) (For US Only).
JANEVSKI, Angel [US/US]; (NL) (For US Only).
BANERJEE, Nilanjana [US/US]; (NL) (For US Only)
Inventors: VARADAN, Vinay; (NL).
MITTAL, Prateek; (NL).
KAMALAKARAN, Sitharthan; (NL).
DIMITROVA, Nevenka; (NL).
JANEVSKI, Angel; (NL).
BANERJEE, Nilanjana; (NL)
Agent: VAN VELZEN, Maaike, M.; High Tech Campus, Building 44 NL-5656 AE Eindhoven (NL)
Priority Data:
61/439,414 04.02.2011 US
Title (EN) METHOD FOR ESTIMATION OF INFORMATION FLOW IN BIOLOGICAL NETWORKS
(FR) PROCÉDÉ D'ÉVALUATION D'UN FLUX D'INFORMATIONS DANS DES RÉSEAUX BIOLOGIQUES
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to a method for stratifying a patient into a clinically relevant group comprising the identification of the probability of an alteration within one or more sets of molecular data from a patient sample in comparison to a database of molecular data of known phenotypes, the inference of the activity of a biological network on the basis of the probabilities, the identification of a network information flow probability for the patient via the probability of interactions in the network, the creation of multiple instances of network information flow for the patient sample and the calculation of the distance of the patient from other subjects in a patient database using multiple instances of the network information flow. The invention further relates to a biomedical marker or group of biomedical markers associated with a high likelihood of responsiveness of a subject to a cancer therapy wherein the biomedical marker or group of biomedical markers comprises altered biological pathway markers, as well as to an assay for detecting, diagnosing, graduating, monitoring or prognosticating a medical condition, or for detecting, diagnosing, monitoring or prognosticating the responsiveness of a subject to a therapy against said medical condition, in particular ovarian cancer. Furthermore, a corresponding clinical decision support system is provided.
(FR)La présente invention concerne un procédé d'assignation d'un patient dans un groupe cliniquement pertinent qui comprend l'identification de la probabilité d'une modification dans un ou plusieurs ensembles de données moléculaires d'un échantillon patient comparé à une base de données de données moléculaires de phénotypes connus, l'inférence de l'activité d'un réseau biologique sur la base des probabilités, l'identification d'une probabilité de flux d'informations de réseau pour le patient via la probabilité des interactions dans le réseau, la création de multiples instances de flux d'informations de réseau pour l'échantillon patient et le calcul de la distance du patient par rapport aux autres sujets dans une base de données utilisant de multiples instances du flux d'informations de réseau. L'invention concerne en outre un marqueur biomédical ou un groupe de marqueurs biomédicaux associés à une grande probabilité de réponse d'un sujet à une thérapie contre le cancer, le marqueur biomédical ou le groupe de marqueurs biomédicaux comprenant des marqueurs de voie biologique présentant une modification, ainsi qu'un test de détection, de diagnostic, de graduation, de surveillance ou de pronostic d'une condition médicale, ou de détection, de diagnostic, de surveillance ou de pronostic que la réponse d'un sujet à une thérapie contre ladite condition médicale, en particulier le cancer des ovaires. La présente invention concerne en outre un système correspondant d'aide à la prise de décision clinique.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)