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1. (WO2012104261) EXONUCLEASE ENABLED PROXIMITY EXTENSION ASSAYS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2012/104261    International Application No.:    PCT/EP2012/051474
Publication Date: 09.08.2012 International Filing Date: 30.01.2012
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), G01N 33/542 (2006.01), G01N 33/58 (2006.01)
Applicants: OLINK AB [SE/SE]; Uppsala Science Park S-751-83 Uppsala (SE) (For All Designated States Except US).
FREDRIKSSON, Simon [SE/SE]; (SE) (For US Only).
LUNDBERG, Martin [SE/SE]; (SE) (For US Only).
ERIKSSON, Anna [SE/SE]; (SE) (For US Only).
RENNEL-DICKENS, Emma [SE/SE]; (SE) (For US Only)
Inventors: FREDRIKSSON, Simon; (SE).
LUNDBERG, Martin; (SE).
ERIKSSON, Anna; (SE).
RENNEL-DICKENS, Emma; (SE)
Agent: DZIEGLEWSKA, Hanna; St Bride's House 10 Salisbury Square London Greater London EC4Y 8JD (GB)
Priority Data:
1101621.9 31.01.2011 GB
Title (EN) EXONUCLEASE ENABLED PROXIMITY EXTENSION ASSAYS
(FR) DOSAGES D'EXTENSION PAR SONDE DE PROXIMITÉ AVEC ACTIVITÉ EXONUCLÉASIQUE
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to a proximity probe based detection assay ("proximity assay") for an analyte in a sample, specifically a proximity probe extension assay (PEA), an in particular to an improvement in the method to reduce non-specific "background" signals, wherein the improvement comprises the use in such assays of a component comprising 3' exonuclease activity, said method comprising: (a) contacting said sample with at least one set of at least first and second proximity probes, which probes each comprise an analyte-binding domain and a nucleic acid domain and can simultaneously bind to the analyte; (b) allowing the nucleic acid domains of the proximity probes to interact with each other upon binding of said proximity probes to said analyte, wherein said interaction comprises the formation of a duplex; (c) contacting said sample with a component comprising 3' exonuclease activity; (d) extending the 3' end of at least one nucleic acid domain of said duplex to generate an extension product, wherein the step may occur contemporaneously with or after step (c); and (e) amplifying and detecting the extension product.
(FR)La présente invention concerne un dosage de détection basé sur une sonde de proximité (« dosage de proximité »), permettant de déterminer la présence d'un analyte dans un échantillon. L'invention porte plus spécifiquement sur un dosage d'extension par sonde de proximité (PEA), et en particulier sur une amélioration apportée au procédé en vue réduire les signaux « de fond » non spécifiques. Ladite amélioration comprend l'utilisation, dans ces dosages, d'un composant présentant une activité exonucléasique 3'. Ledit procédé comprend les étapes suivantes : (a) mise en contact dudit échantillon avec au moins un ensemble comportant au moins des première et seconde sondes de proximité, lesdites sondes comprenant chacune un domaine fixant l'analyte et un domaine d'acide nucléique, et pouvant simultanément se lier à l'analyte ; (b) interaction des domaines d'acide nucléique des sondes de proximité l'un avec l'autre lors de la liaison desdites sondes de proximité audit analyte, ladite interaction comprenant la formation d'un duplex ; (c) mise en contact dudit échantillon avec un composant comprenant une activité exonucléase 3' ; (d) extension de l'extrémité 3' d'au moins un domaine d'acide nucléique dudit duplex pour produire un produit d'extension, ladite étape pouvant avoir lieu de manière concomitante avec l'étape (c) ou après cette dernière ; et (e) amplification et détection du produit d'extension.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)