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1. (WO2012100963) SEED TRAIT PREDICTION BY ACTIVITY-BASED PROTEIN PROFILING
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2012/100963    International Application No.:    PCT/EP2012/000396
Publication Date: 02.08.2012 International Filing Date: 30.01.2012
Chapter 2 Demand Filed:    28.11.2012    
IPC:
G01N 33/68 (2006.01)
Applicants: MAX-PLANCK-GESELLSCHAFT ZUR FÖRDERUNG DER WISSENSCHAFTEN E.V. [DE/DE]; Hofgartenstrasse 8 80539 München (DE) (For All Designated States Except US).
NINSAR AGROSCIENCES SL [ES/ES]; Parc Cientific de Barcelona C/Baldiri Reixac 4-8 Office Ti04B6 E-08028 Barcelona (ES) (For All Designated States Except US).
GAUTIER SEMENCES [FR/FR]; Route d'Avignon F-13630 Eyragues (FR) (For All Designated States Except US).
VAN DER HOORN, Renier, A., L. [DE/DE]; (DE) (For US Only).
GU, Chirstian [DE/DE]; (DE) (For US Only).
FARNUSCH, Kaschani [DE/DE]; (DE) (For US Only).
MISAS, Johana [DE/DE]; (DE) (For US Only).
RICHAU, Kerstin [DE/DE]; (DE) (For US Only).
KOLODZIEJEK, Izabella [DE/DE]; (DE) (For US Only).
MOQUET, Frédéric [FR/FR]; (FR) (For US Only).
MALLIART, Capucine [FR/FR]; (FR) (For US Only).
BERTHET, Xavier [ES/ES]; (ES) (For US Only).
RAMOS, Oscar, Goni [ES/ES]; (ES) (For US Only).
ELLUL, Philippe [ES/ES]; (ES) (For US Only)
Inventors: VAN DER HOORN, Renier, A., L.; (DE).
GU, Chirstian; (DE).
FARNUSCH, Kaschani; (DE).
MISAS, Johana; (DE).
RICHAU, Kerstin; (DE).
KOLODZIEJEK, Izabella; (DE).
MOQUET, Frédéric; (FR).
MALLIART, Capucine; (FR).
BERTHET, Xavier; (ES).
RAMOS, Oscar, Goni; (ES).
ELLUL, Philippe; (ES)
Agent: MAIWALD PATENTANWALTS GMBH; Elisenhof Elisenstr. 3 80335 Munich (DE)
Priority Data:
11152509.3 28.01.2011 EP
61/437,496 28.01.2011 US
Title (EN) SEED TRAIT PREDICTION BY ACTIVITY-BASED PROTEIN PROFILING
(FR) PRÉDICTION DES SPÉCIFICITÉS D'UNE GRAINE PAR PROFILAGE DES PROTÉINES EN FONCTION DE LEUR ACTIVITÉ
Abstract: front page image
(EN)The present invention relates to a method of predicting a plant seed trait, such as germination rate, vigour, aging and priming, by determining the presence of a target protein, i.e. diagnostic marker, in its active state in a protein sample derived from a plant seed or plant seed lot. Thereby, the quality of a plant seed or a plant seed lot can be predicted and/or diagnosed and seeds may be distinguished on basis of their characteristics and with respect to the traits described herein. Inter alia, seeds and seed lots having high germination quality may be distinguished from seeds and seed lots having low germination quality. In particular, the method comprises contacting the protein sample or the plant seed or plant seed lot with a chemical probe comprising a warhead being able to attach to an amino acid residue in or nearby an active site of the target protein under conditions allowing the formation of a conjugate of the target protein and the chemical probe, wherein the chemical probe further comprises a reporter tag which is used to detect the conjugate, and wherein detection of the conjugate indicates the presence of the target protein in the protein sample and is used to predict or diagnose the plant seed trait. The present invention further relates to the use of such chemical probes for the prediction of plant seed traits.
(FR)Cette invention concerne une méthode permettant de prédire une spécificité d'une graine végétale, tel que la vitesse de germination, la vigueur, le vieillissement et la réaction au traitement de prégermination, par détermination de la présence d'une protéine cible, à savoir, un marqueur diagnostique, à l'état actif dans un échantillon de protéines provenant d'une graine végétale ou d'un lot de graines végétales. De ce fait, la qualité d'une graine végétale ou d'un lot de graines végétales peut être prédite et/ou diagnostiquée et les graines peuvent être séparées en fonction de leurs caractéristiques et des spécificités ci-décrites. Inter alia, les graines et les lots de graines ayant une forte qualité de germination peuvent être séparés des graines et des lots de graines ayant une faible qualité de germination. En particulier, la méthode selon l'invention comprend la mise en contact de l'échantillon de protéines ou de la graine végétale ou du lot de graines végétales avec une sonde chimique comportant une ogive capable de se fixer à un résidu acide aminé dans ou à proximité du site actif de la protéine cible dans des conditions permettant la formation d'un conjugué constitué de la protéine cible et de la sonde chimique, la sonde chimique comprenant en outre une étiquette rapporteur qui sert à détecter le conjugué, la détection du conjugué indiquant la présence de la protéine cible dans l'échantillon de protéines et servant à prédire ou à diagnostiquer la spécificité d'une graine végétale. La présente invention concerne également l'utilisation desdites sondes chimiques pour prédire les spécificités d'une graine végétale.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)