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1. (WO2012097319) HIGHLY EFFICIENT GENE-REGULATORY ELEMENT SCREENING ASSAY AND COMPOSITIONS FOR PERFORMING THE SAME
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2012/097319    International Application No.:    PCT/US2012/021349
Publication Date: 19.07.2012 International Filing Date: 13.01.2012
IPC:
C12N 15/09 (2006.01), C12N 15/63 (2006.01), C12Q 1/02 (2006.01)
Applicants: THE BOARD OF TRUSTEES OF THE LELAND STANFORD JUNIOR UNIVERSITY [US/US]; 1705 El Camino Real Palo Alto, California 94306-1106 (US) (For All Designated States Except US).
LIANG, Joe C. [US/US]; (US) (For US Only).
SMOLKE, Christina D. [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: LIANG, Joe C.; (US).
SMOLKE, Christina D.; (US)
Agent: FIELD, Bret E.; Bozicevic, Field & Francis LLP 1900 University Avenue, Suite 200 East Palo Alto, California 94303 (US)
Priority Data:
61/432,287 13.01.2011 US
Title (EN) HIGHLY EFFICIENT GENE-REGULATORY ELEMENT SCREENING ASSAY AND COMPOSITIONS FOR PERFORMING THE SAME
(FR) ANALYSE PAR CRIBLAGE D'ÉLÉMENTS DE RÉGULATION GÉNIQUE D'EFFICACITÉ ÉLEVÉE ET COMPOSITIONS DESTINÉES À METTRE EN ŒUVRE CELLE-CI
Abstract: front page image
(EN)Methods of evaluating a gene-regulatory element, including libraries of known or candidate gene-regulatory elements, are provided. Aspects of the methods include cytometrically analyzing a cell comprising a gene-regulatory element construct, e.g., a plasmid, having an activity reporter comprising a first signal reporter domain which produces a first signal operatively coupled to a gene-regulatory element of interest; and a noise reporter comprising a second signal reporter which produces a second signal that is distinguishable from the first signal to obtain the first and second signals. The first signal is then normalized with the second signal to obtain a normalized activity signal, which normalized activity signal is then employed to evaluate the gene-regulatory element. Also provided are reagents, systems and kits that find use in practicing methods of the invention.
(FR)La présente invention concerne des procédés d'évaluation d'un élément de régulation génique, y compris de banques d'éléments de régulation génique connus ou de composés candidats. Des aspects des procédés de la présente invention comprennent l'analyse cytométrique d'une cellule comprenant une construction d'un élément de régulation génique, par exemple, un plasmide, comprenant un gène rapporteur d'activité comprenant un domaine de rapporteur de premier signal produisant un premier signal couplé de manière fonctionnelle à un élément de régulation génique intéressant ; et un rapporteur de bruit comprenant un rapporteur de second signal produisant un second signal qui peut être distingué du premier signal afin d'obtenir le premier et le second signaux. Le premier signal est ensuite normalisé au second signal afin d'obtenir un signal d'activité normalisé, lequel signal d'activité normalisé est ensuite utilisé pour évaluer l'élément de régulation génique. L'invention concerne également des réactifs, des systèmes et des kits qui trouvent leur utilité dans les procédés de la présente invention.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)