WIPO logo
Mobile | Deutsch | Español | Français | 日本語 | 한국어 | Português | Русский | 中文 | العربية |
PATENTSCOPE

Search International and National Patent Collections
World Intellectual Property Organization
Search
 
Browse
 
Translate
 
Options
 
News
 
Login
 
Help
 
Machine translation
1. (WO2012097152) METHODS AND SYSTEMS FOR PREDICTIVE MODELING OF HIV-1 REPLICATION CAPACITY
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2012/097152    International Application No.:    PCT/US2012/021080
Publication Date: 19.07.2012 International Filing Date: 12.01.2012
IPC:
G01N 33/48 (2006.01), G01N 33/50 (2006.01), G06Q 10/00 (2012.01)
Applicants: LABORATORY CORPORATION OF AMERICA HOLDINGS [US/US]; 531 South Spring Street Burlington, North Carolina 27215 (US) (For All Designated States Except US).
HADDAD, Mojgan [US/US]; (US) (For US Only).
BONHOEFFER, Sebastian [DE/CH]; (CH) (For US Only).
HINKLEY, Trevor [GB/GB]; (GB) (For US Only)
Inventors: HADDAD, Mojgan; (US).
BONHOEFFER, Sebastian; (CH).
HINKLEY, Trevor; (GB)
Agent: CALKINS, Charles W.; Kilpatrick Townsend and Stockton LLP 1001 W. Fourth Street Winston-Salem, North Carolina 27101-2400 (US)
Priority Data:
61/432,271 13.01.2011 US
Title (EN) METHODS AND SYSTEMS FOR PREDICTIVE MODELING OF HIV-1 REPLICATION CAPACITY
(FR) PROCÉDÉS ET SYSTÈMES DE MODÉLISATION PRÉDICTIVE DE LA CAPACITÉ DE RÉPLICATION DU VIH-1
Abstract: front page image
(EN)Methods, systems, and computer readable media perform predictive modeling of gene activity. The methods may comprise obtaining the amino acid and/or nucleic acid sequence of a portion of the at least one gene from a biological sample obtained from a subject; comparing the amino acid and/or nucleic acid sequence of the portion of the at least one gene to a database of sequences for the portion of the at least one gene and for which the biological activity of the at least one gene has been evaluated; and applying a generalization of ridge regression analysis to estimate the effects of individual mutations in the at least one gene. A model is based on generalization of ridge regression (GRR) analysis to estimate the effects of individual mutations in at least one gene for the subject. At least one gene may comprise the reverse transcriptase and protease genes of an HIV vims.
(FR)L'invention concerne des procédés et des systèmes de modélisation prédictive de l'activité d'un gène. Dans certains modes de réalisation, les procédés peuvent comprendre les étapes consistant à obtenir la séquence d'acides aminés et/ou la séquence d'acide nucléique d'une partie du ou des gènes présents dans un échantillon biologique prélevé chez un sujet ; à comparer la séquence d'acides aminés et/ou la séquence d'acide nucléique de la partie du ou des gènes à une base de données de séquences concernant la partie du ou des gènes pour laquelle l'activité biologique du ou des gènes a été évaluée ; et à appliquer une généralisation d'une analyse par régression pseudo-orthogonale pour estimer les effets de mutations individuelles dans le ou les gènes. L'invention concerne, en outre, des systèmes et des supports lisibles par ordinateur permettant la mise en œuvre du procédé.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)