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1. (WO2012047889) SYSTEMS AND METHODS FOR AUTOMATED REUSABLE PARALLEL BIOLOGICAL REACTIONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2012/047889    International Application No.:    PCT/US2011/054769
Publication Date: 12.04.2012 International Filing Date: 04.10.2011
IPC:
G01N 33/551 (2006.01), C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: GENAPSYS INC. [US/US]; 1455 Adams Drive Suite 2104 Menlo Park, California 94025 (US) (For All Designated States Except US).
ESFANDYARPOUR, Hesaam [IR/US]; (US) (For US Only).
Kosar B, PARIZI [IR/US]; (US) (For US Only).
Mark F. Oldham [US/US]; (US) (For US Only).
Eric S. Nordman [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: ESFANDYARPOUR, Hesaam; (US).
Kosar B, PARIZI; (US).
Mark F. Oldham; (US).
Eric S. Nordman; (US)
Agent: WU, Nan; 777 6th Street N.W. Suite 1100 Washington, District of Columbia 20001 (US)
Priority Data:
61/389,484 04.10.2010 US
61/389,490 04.10.2010 US
61/443,167 15.02.2011 US
61/491,081 27.05.2011 US
Title (EN) SYSTEMS AND METHODS FOR AUTOMATED REUSABLE PARALLEL BIOLOGICAL REACTIONS
(FR) SYSTÈMES ET PROCÉDÉS DE RÉACTIONS BIOLOGIQUES PARALLÈLES, RÉUTILISABLES, AUTOMATIQUES
Abstract: front page image
(EN)A method comprises magnetically holding a bead carrying biological material (e.g., nucleic acid, which may be in the form of DNA fragments or amplified DNA) in a specific location of a substrate, and applying an electric field local to the bead to isolate the biological material or products or byproducts of reactions of the biological material. For example, the bead is isolated from other beads having associated biological material. The electric field in various embodiments concentrates reagents for an amplification or sequencing reaction, and/or concentrates and isolates detectable reaction by-products. For example, by isolating nucleic acids around individual beads, the electric field can allow for clonal amplification, as an alternative to emulsion PCR. In other embodiments, the electric field isolates a nanosensor proximate to the bead, to facilitate detection of at least one of local pH change, local conductivity change, local charge concentration change and local heat. The beads may be trapped in the form of an array of localized magnetic field regions.
(FR)L'invention concerne un procédé qui comporte le maintien magnétique d'une bille portant un matériau biologique (par exemple un acide nucléique, qui peut être sous la forme de fragments d'ADN ou d'ADN amplifié) dans un emplacement précis d'un substrat, et l'application d'un champ électrique local à la bille pour isoler le matériau biologique ou les produits ou sous-produits de réaction du matériau biologique. Par exemple, la bille est isolée des autres billes ayant un matériau biologique associé. Le champ électrique dans divers modes de réalisation concentre des réactifs pour une réaction d'amplification ou de séquençage et/ou concentre et isole des sous-produits détectables de réaction. Par exemple, par l'isolement d'acides nucléiques autour des billes individuelles, le champ électrique peut permettre une amplification clonale, comme alternative à une PCR en émulsion. Dans d'autres modes de réalisation, le champ électrique isole un nanocapteur à proximité de la bille pour faciliter la détection d'au moins un changement parmi un changement local de pH, un changement local de conductivité, un changement local de concentration en charges et une chaleur locale. Les billes peuvent être piégées sous la forme d'un réseau de régions de champ magnétique localisé.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, QA, RO, RS, RU, RW, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, RW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)