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1. (WO2011140510) OLIGONUCLEOTIDE LIGATION, BARCODING AND METHODS AND COMPOSITIONS FOR IMPROVING DATA QUALITY AND THROUGHPUT USING MASSIVELY PARALLEL SEQUENCING
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2011/140510    International Application No.:    PCT/US2011/035633
Publication Date: 10.11.2011 International Filing Date: 06.05.2011
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01), C12N 15/10 (2006.01), C12N 15/11 (2006.01)
Applicants: BIOO SCIENTIFIC CORPORATION [US/US]; 3913 Todd Lane, Suite 312 Austin, Texas 78744 (US) (For All Designated States Except US).
TOLOUE, Masoud, M. [US/US]; (US) (For US Only).
GOLDRICK, Marianna [US/US]; (US) (For US Only)
Inventors: TOLOUE, Masoud, M.; (US).
GOLDRICK, Marianna; (US)
Agent: MEYERTONS, HOOD, KIVLIN, KOWERT & GOETZEL, P.C.; MEYERTONS, Eric B. P.O. Box 398 Austin, Texas 78767-0398 (US)
Priority Data:
61/332,104 06.05.2010 US
Title (EN) OLIGONUCLEOTIDE LIGATION, BARCODING AND METHODS AND COMPOSITIONS FOR IMPROVING DATA QUALITY AND THROUGHPUT USING MASSIVELY PARALLEL SEQUENCING
(FR) LIGATURE D'OLIGONUCLÉOTIDES, ATTRIBUTION DE CODE-BARRES, PROCÉDÉS ET COMPOSITIONS POUR AMÉLIORATION DE QUALITÉ DES DONNÉES ET DU DÉBIT À L'AIDE DU SÉQUENÇAGE MASSIF PARALLÈLE
Abstract: front page image
(EN)Described herein is a buffer concentration for highly efficient ligation of two oligonucleotides. The embodiments herein have led to the development of an optimized ligation step used in the sample preparation for sequencing reactions. Further, embodiments herein describe a high-throughput method for sequencing using barcodes or the purpose of multiplexing several samples simultaneously and novel methods for making targeted DNA libraries for re-sequencing on massively parallel next-generation sequencing platforms and for alternatives to gel-purification for recovering the desired templates from small RNA libraries for next generation sequencing.
(FR)La présente invention porte une concentration de tampon pour une ligature extrêmement efficace de deux oligonucléotides. Les modes de réalisation de la présente invention ont conduit au développement d'une étape de ligature optimisée utilisée dans la préparation d'échantillons pour des réactions de séquençage. En outre, des modes de réalisation de la présente invention décrivent un procédé à haut débit pour le séquençage à l'aide de code-barres ou l'objectif de multiplexage de plusieurs échantillons simultanément et des nouveaux procédés de génération de banques d'ADN cibles pour le re-séquençage sur des plateformes de séquençage massif parallèle de nouvelle génération et pour des alternatives à la purification sur gel pour la récupération de matrices voulues à partir de banques de petits ARN pour le séquençage de nouvelle génération.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)