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1. (WO2011135058) METHODS FOR DETECTING EPIGENETIC MODIFICATIONS
Latest bibliographic data on file with the International Bureau   

Pub. No.:    WO/2011/135058    International Application No.:    PCT/EP2011/056797
Publication Date: 03.11.2011 International Filing Date: 28.04.2011
IPC:
C12Q 1/68 (2006.01)
Applicants: MDXHEALTH SA [BE/BE]; Tour 5 GIGA Niveau +3 Avenue de l'Hopital 11 Sart-Tilman B-4000 Liege (BE) (For All Designated States Except US).
LOUWAGIE, Joost [BE/BE]; (BE) (For US Only).
OTTO, Gaetan [BE/BE]; (BE) (For US Only)
Inventors: LOUWAGIE, Joost; (BE).
OTTO, Gaetan; (BE)
Agent: SPENCER, Matthew; Boult Wade Tennant Verulam Gardens 70 Gray's Inn Road London WC1X 8BT (GB)
Priority Data:
61/329,982 30.04.2010 US
Title (EN) METHODS FOR DETECTING EPIGENETIC MODIFICATIONS
(FR) PROCÉDÉ DE DÉTECTION DE MODIFICATIONS ÉPIGÉNÉTIQUES
Abstract: front page image
(EN)A method of determining the methylation status of a gene, in particular at least SYNE1 in a sample, such as a blood sample, in particular a blood plasma or serum sample, comprises the following steps: (a) isolating DNA from the sample (which may be a blood sample, in particular a plasma or serum sample) (b) subjecting the isolated DNA to treatment with a reagent which selectively modifies unmethylated cytosine residues in the DNA contained in the sample to produce detectable modified residues but which does not modify methylated cytosine residues (c) amplifying both treated isolated DNA strands. Amplification occurs in a manner that investigates the methylation status of both DNA strands. Detection of amplification products may be indicative of the methylation status of the gene, in particular the SYNE1 gene. The methods may be useful diagnostically, for example to indicate cancer in a sample. Various kits, primers and probes are also provided.
(FR)La présente invention concerne un procédé de détermination du statut de méthylation d'un gène, en particulier d'au moins SYNE1 dans un échantillon, tel qu'un échantillon de sang, en particulier un échantillon de plasma sanguin ou de sérum, qui comprend les étapes suivantes : (a) l'isolement d'ADN de l'échantillon (qui peut être un échantillon de sang, en particulier un échantillon de plasma ou de sérum) ; (b) la soumission de l'ADN isolé à un traitement avec un réactif qui modifie sélectivement les résidus de cytosine non méthylés dans l'ADN contenu dans l'échantillon pour produire des résidus modifiés détectables mais qui ne modifie pas les résidus de cytosine méthylés ; (c) l'amplification des deux brins d'ADN isolés et traités. L'amplification se produit d'une manière qui étudie le statut de méthylation des deux brins d'ADN. La détection des produits d'amplification peut être un indicateur du statut de méthylation du gène, notamment du gène SYNE1. Le procédé peut être utile sur le plan diagnostique, par exemple pour indiquer un cancer dans un échantillon. La présente invention concerne en outre différents kits, différentes amorces et différentes sondes.
Designated States: AE, AG, AL, AM, AO, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BH, BR, BW, BY, BZ, CA, CH, CL, CN, CO, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DO, DZ, EC, EE, EG, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, GT, HN, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KM, KN, KP, KR, KZ, LA, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LY, MA, MD, ME, MG, MK, MN, MW, MX, MY, MZ, NA, NG, NI, NO, NZ, OM, PE, PG, PH, PL, PT, RO, RS, RU, SC, SD, SE, SG, SK, SL, SM, ST, SV, SY, TH, TJ, TM, TN, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VC, VN, ZA, ZM, ZW.
African Regional Intellectual Property Organization (BW, GH, GM, KE, LR, LS, MW, MZ, NA, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZM, ZW)
Eurasian Patent Organization (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM)
European Patent Office (AL, AT, BE, BG, CH, CY, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, FR, GB, GR, HR, HU, IE, IS, IT, LT, LU, LV, MC, MK, MT, NL, NO, PL, PT, RO, RS, SE, SI, SK, SM, TR)
African Intellectual Property Organization (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GQ, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG).
Publication Language: English (EN)
Filing Language: English (EN)