(EN) The present invention is based on the discovery that functional stratification and/or signaling profiles can be used for diagnosing disease status, determining drug resistance or sensitivity of cancer cells, monitoring a disease or responsiveness to a therapeutic agent, and/or predicting a therapeutic outcome for a subject. Provided herein are assays for diagnosis and/or prognosis of diseases in patients. Also provided are compositions and methods that evaluate the resistance or sensitivity of diseases to targeted therapeutic agents prior to initiation of the therapeutic regimen and to monitor the therapeutic effects of the therapeutic regimen. Also provided are methods for determining the difference between a basal level or state of a molecule in a sample and the level or state of the molecule after stimulation of a portion of the live sample with a modulator ex vivo, wherein the difference is expressed as a value which is indicative of the presence, absence or risk of having a disease. The methods of the invention may also be used for predicting the effect of an agent on the disease and monitoring the course of a subject's therapy.
(FR) La présente invention concerne la découverte selon laquelle la stratification fonctionnelle et/ou les profils de signalisation peuvent être utilisés pour le diagnostic de l'état d'une maladie, la détermination de la résistance ou de la sensibilité des cellules cancéreuses à un médicament, la surveillance d'une maladie ou la sensibilité à un agent thérapeutique, et/ou la prédiction d'un résultat thérapeutique pour un patient. L'invention concerne des dosages permettant le diagnostic et/ou le pronostic de maladies chez des patients. L'invention concerne également des compositions et des méthodes qui évaluent la résistance ou la sensibilité de maladies à des agents thérapeutiques ciblés avant le début du schéma thérapeutique et qui surveillent les effets thérapeutiques du schéma thérapeutique. L'invention concerne également des méthodes permettant de déterminer la différence entre un niveau ou un état basal d'une molécule dans un échantillon et le niveau ou l'état de la molécule après stimulation d'une partie de l'échantillon vivant avec un modulateur ex vivo, la différence étant exprimée comme une valeur qui indique la présence ou l'absence d'une maladie, ou le risque de la développer. Les méthodes de l'invention peuvent également être utilisées pour prédire l'effet d'un agent sur la maladie et pour surveiller le déroulement du traitement d'un patient.